Protein–RNA interactions for Protein: P49766

Vegfb, Vascular endothelial growth factor B, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfbP49766 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VegfbP49766 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
VegfbP49766 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VegfbP49766 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VegfbP49766 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
VegfbP49766 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
VegfbP49766 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
VegfbP49766 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
VegfbP49766 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VegfbP49766 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VegfbP49766 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VegfbP49766 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VegfbP49766 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VegfbP49766 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VegfbP49766 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VegfbP49766 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
VegfbP49766 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
VegfbP49766 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VegfbP49766 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
VegfbP49766 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VegfbP49766 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VegfbP49766 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VegfbP49766 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VegfbP49766 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VegfbP49766 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VegfbP49766 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VegfbP49766 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VegfbP49766 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VegfbP49766 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VegfbP49766 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VegfbP49766 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VegfbP49766 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VegfbP49766 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VegfbP49766 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
VegfbP49766 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VegfbP49766 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VegfbP49766 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VegfbP49766 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VegfbP49766 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VegfbP49766 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VegfbP49766 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VegfbP49766 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VegfbP49766 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VegfbP49766 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VegfbP49766 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VegfbP49766 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VegfbP49766 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VegfbP49766 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VegfbP49766 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VegfbP49766 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VegfbP49766 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VegfbP49766 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VegfbP49766 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VegfbP49766 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VegfbP49766 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VegfbP49766 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VegfbP49766 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VegfbP49766 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VegfbP49766 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VegfbP49766 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
VegfbP49766 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
VegfbP49766 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VegfbP49766 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VegfbP49766 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VegfbP49766 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
VegfbP49766 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
VegfbP49766 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VegfbP49766 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VegfbP49766 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VegfbP49766 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VegfbP49766 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VegfbP49766 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VegfbP49766 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VegfbP49766 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VegfbP49766 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
VegfbP49766 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
VegfbP49766 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VegfbP49766 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VegfbP49766 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VegfbP49766 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VegfbP49766 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VegfbP49766 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
VegfbP49766 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VegfbP49766 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VegfbP49766 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
VegfbP49766 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VegfbP49766 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VegfbP49766 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VegfbP49766 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VegfbP49766 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
VegfbP49766 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VegfbP49766 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
VegfbP49766 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VegfbP49766 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VegfbP49766 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VegfbP49766 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VegfbP49766 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VegfbP49766 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VegfbP49766 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VegfbP49766 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms