Protein–RNA interactions for Protein: P47857

Pfkm, ATP-dependent 6-phosphofructokinase, muscle type, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PfkmP47857 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PfkmP47857 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PfkmP47857 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PfkmP47857 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PfkmP47857 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PfkmP47857 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PfkmP47857 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PfkmP47857 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PfkmP47857 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PfkmP47857 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PfkmP47857 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PfkmP47857 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PfkmP47857 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PfkmP47857 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PfkmP47857 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PfkmP47857 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PfkmP47857 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PfkmP47857 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PfkmP47857 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PfkmP47857 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PfkmP47857 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PfkmP47857 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PfkmP47857 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PfkmP47857 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PfkmP47857 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PfkmP47857 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PfkmP47857 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PfkmP47857 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
PfkmP47857 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PfkmP47857 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PfkmP47857 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PfkmP47857 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PfkmP47857 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PfkmP47857 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PfkmP47857 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PfkmP47857 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PfkmP47857 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PfkmP47857 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PfkmP47857 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PfkmP47857 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PfkmP47857 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PfkmP47857 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PfkmP47857 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PfkmP47857 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PfkmP47857 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PfkmP47857 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PfkmP47857 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PfkmP47857 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PfkmP47857 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PfkmP47857 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PfkmP47857 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PfkmP47857 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PfkmP47857 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PfkmP47857 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PfkmP47857 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PfkmP47857 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PfkmP47857 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PfkmP47857 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PfkmP47857 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PfkmP47857 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PfkmP47857 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PfkmP47857 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PfkmP47857 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PfkmP47857 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PfkmP47857 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PfkmP47857 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PfkmP47857 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PfkmP47857 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PfkmP47857 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PfkmP47857 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PfkmP47857 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PfkmP47857 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PfkmP47857 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PfkmP47857 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PfkmP47857 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PfkmP47857 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PfkmP47857 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PfkmP47857 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PfkmP47857 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PfkmP47857 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PfkmP47857 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PfkmP47857 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PfkmP47857 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PfkmP47857 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PfkmP47857 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PfkmP47857 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PfkmP47857 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PfkmP47857 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PfkmP47857 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PfkmP47857 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PfkmP47857 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PfkmP47857 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PfkmP47857 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PfkmP47857 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PfkmP47857 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PfkmP47857 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PfkmP47857 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PfkmP47857 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PfkmP47857 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PfkmP47857 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms