Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab11bP46638 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab11bP46638 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab11bP46638 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab11bP46638 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab11bP46638 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab11bP46638 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab11bP46638 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab11bP46638 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab11bP46638 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab11bP46638 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab11bP46638 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab11bP46638 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab11bP46638 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab11bP46638 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab11bP46638 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab11bP46638 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab11bP46638 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab11bP46638 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab11bP46638 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab11bP46638 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab11bP46638 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab11bP46638 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab11bP46638 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rab11bP46638 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab11bP46638 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab11bP46638 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab11bP46638 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab11bP46638 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab11bP46638 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab11bP46638 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab11bP46638 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab11bP46638 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab11bP46638 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab11bP46638 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab11bP46638 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab11bP46638 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab11bP46638 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab11bP46638 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab11bP46638 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab11bP46638 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab11bP46638 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab11bP46638 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab11bP46638 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab11bP46638 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab11bP46638 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab11bP46638 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab11bP46638 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab11bP46638 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab11bP46638 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab11bP46638 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab11bP46638 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab11bP46638 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab11bP46638 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab11bP46638 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab11bP46638 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab11bP46638 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab11bP46638 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab11bP46638 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab11bP46638 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab11bP46638 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab11bP46638 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab11bP46638 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab11bP46638 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab11bP46638 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab11bP46638 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab11bP46638 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab11bP46638 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab11bP46638 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab11bP46638 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab11bP46638 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab11bP46638 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab11bP46638 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rab11bP46638 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rab11bP46638 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rab11bP46638 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab11bP46638 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab11bP46638 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab11bP46638 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab11bP46638 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab11bP46638 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab11bP46638 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab11bP46638 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab11bP46638 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab11bP46638 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab11bP46638 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab11bP46638 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab11bP46638 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab11bP46638 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab11bP46638 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab11bP46638 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab11bP46638 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab11bP46638 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab11bP46638 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab11bP46638 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab11bP46638 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab11bP46638 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab11bP46638 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab11bP46638 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab11bP46638 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms