Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gdf5P43027 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gdf5P43027 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gdf5P43027 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gdf5P43027 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gdf5P43027 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gdf5P43027 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gdf5P43027 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gdf5P43027 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gdf5P43027 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gdf5P43027 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gdf5P43027 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gdf5P43027 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gdf5P43027 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gdf5P43027 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gdf5P43027 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gdf5P43027 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gdf5P43027 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gdf5P43027 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gdf5P43027 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gdf5P43027 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gdf5P43027 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Gdf5P43027 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gdf5P43027 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Gdf5P43027 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gdf5P43027 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gdf5P43027 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gdf5P43027 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gdf5P43027 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gdf5P43027 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gdf5P43027 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gdf5P43027 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gdf5P43027 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gdf5P43027 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gdf5P43027 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gdf5P43027 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gdf5P43027 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gdf5P43027 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gdf5P43027 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gdf5P43027 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gdf5P43027 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gdf5P43027 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gdf5P43027 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gdf5P43027 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gdf5P43027 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gdf5P43027 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gdf5P43027 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gdf5P43027 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gdf5P43027 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Gdf5P43027 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gdf5P43027 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gdf5P43027 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Gdf5P43027 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gdf5P43027 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gdf5P43027 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gdf5P43027 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gdf5P43027 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gdf5P43027 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gdf5P43027 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gdf5P43027 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Gdf5P43027 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gdf5P43027 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gdf5P43027 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gdf5P43027 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gdf5P43027 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gdf5P43027 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gdf5P43027 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gdf5P43027 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gdf5P43027 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Gdf5P43027 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gdf5P43027 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gdf5P43027 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gdf5P43027 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gdf5P43027 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Gdf5P43027 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gdf5P43027 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gdf5P43027 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gdf5P43027 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gdf5P43027 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gdf5P43027 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gdf5P43027 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gdf5P43027 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gdf5P43027 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gdf5P43027 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gdf5P43027 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gdf5P43027 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gdf5P43027 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gdf5P43027 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gdf5P43027 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gdf5P43027 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gdf5P43027 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gdf5P43027 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gdf5P43027 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gdf5P43027 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gdf5P43027 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gdf5P43027 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gdf5P43027 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gdf5P43027 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gdf5P43027 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gdf5P43027 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms