Protein–RNA interactions for Protein: P42703

Lifr, Leukemia inhibitory factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,092 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LifrP42703 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LifrP42703 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LifrP42703 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LifrP42703 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LifrP42703 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LifrP42703 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LifrP42703 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LifrP42703 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
LifrP42703 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LifrP42703 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
LifrP42703 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LifrP42703 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LifrP42703 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LifrP42703 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LifrP42703 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LifrP42703 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LifrP42703 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LifrP42703 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LifrP42703 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LifrP42703 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LifrP42703 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LifrP42703 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LifrP42703 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LifrP42703 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LifrP42703 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LifrP42703 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LifrP42703 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LifrP42703 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LifrP42703 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LifrP42703 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LifrP42703 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LifrP42703 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
LifrP42703 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC26■■□□□ 1.75
LifrP42703 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LifrP42703 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LifrP42703 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LifrP42703 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC26■■□□□ 1.75
LifrP42703 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LifrP42703 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LifrP42703 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LifrP42703 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LifrP42703 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
LifrP42703 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LifrP42703 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LifrP42703 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LifrP42703 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LifrP42703 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LifrP42703 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LifrP42703 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LifrP42703 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
LifrP42703 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LifrP42703 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
LifrP42703 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LifrP42703 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LifrP42703 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LifrP42703 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LifrP42703 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LifrP42703 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
LifrP42703 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
LifrP42703 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LifrP42703 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LifrP42703 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LifrP42703 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LifrP42703 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LifrP42703 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
LifrP42703 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LifrP42703 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LifrP42703 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LifrP42703 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LifrP42703 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LifrP42703 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LifrP42703 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LifrP42703 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LifrP42703 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LifrP42703 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LifrP42703 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LifrP42703 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LifrP42703 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LifrP42703 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LifrP42703 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LifrP42703 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LifrP42703 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LifrP42703 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LifrP42703 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LifrP42703 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LifrP42703 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LifrP42703 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LifrP42703 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LifrP42703 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LifrP42703 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LifrP42703 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LifrP42703 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LifrP42703 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LifrP42703 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LifrP42703 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
LifrP42703 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LifrP42703 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
LifrP42703 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LifrP42703 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LifrP42703 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms