Protein–RNA interactions for Protein: P40223

Csf3r, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3rP40223 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Csf3rP40223 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Csf3rP40223 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Csf3rP40223 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Csf3rP40223 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Csf3rP40223 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Csf3rP40223 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Csf3rP40223 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Csf3rP40223 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csf3rP40223 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csf3rP40223 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csf3rP40223 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csf3rP40223 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csf3rP40223 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csf3rP40223 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csf3rP40223 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Csf3rP40223 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Csf3rP40223 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Csf3rP40223 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Csf3rP40223 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Csf3rP40223 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csf3rP40223 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csf3rP40223 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csf3rP40223 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csf3rP40223 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csf3rP40223 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csf3rP40223 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csf3rP40223 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csf3rP40223 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csf3rP40223 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csf3rP40223 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csf3rP40223 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csf3rP40223 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csf3rP40223 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csf3rP40223 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Csf3rP40223 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Csf3rP40223 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Csf3rP40223 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Csf3rP40223 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Csf3rP40223 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Csf3rP40223 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Csf3rP40223 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csf3rP40223 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csf3rP40223 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csf3rP40223 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csf3rP40223 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csf3rP40223 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csf3rP40223 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Csf3rP40223 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csf3rP40223 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csf3rP40223 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csf3rP40223 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csf3rP40223 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Csf3rP40223 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Csf3rP40223 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Csf3rP40223 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Csf3rP40223 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Csf3rP40223 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Csf3rP40223 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Csf3rP40223 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Csf3rP40223 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Csf3rP40223 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Csf3rP40223 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Csf3rP40223 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Csf3rP40223 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Csf3rP40223 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Csf3rP40223 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Csf3rP40223 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Csf3rP40223 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Csf3rP40223 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Csf3rP40223 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Csf3rP40223 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Csf3rP40223 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Csf3rP40223 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Csf3rP40223 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Csf3rP40223 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Csf3rP40223 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csf3rP40223 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csf3rP40223 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csf3rP40223 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csf3rP40223 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csf3rP40223 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csf3rP40223 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csf3rP40223 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csf3rP40223 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csf3rP40223 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csf3rP40223 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csf3rP40223 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csf3rP40223 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csf3rP40223 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csf3rP40223 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csf3rP40223 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Csf3rP40223 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csf3rP40223 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csf3rP40223 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csf3rP40223 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Csf3rP40223 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csf3rP40223 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csf3rP40223 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csf3rP40223 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms