Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Traf1P39428 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Traf1P39428 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Traf1P39428 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Traf1P39428 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Traf1P39428 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Traf1P39428 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Traf1P39428 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Traf1P39428 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Traf1P39428 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Traf1P39428 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Traf1P39428 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Traf1P39428 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Traf1P39428 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Traf1P39428 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Traf1P39428 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Traf1P39428 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Traf1P39428 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Traf1P39428 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Traf1P39428 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Traf1P39428 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Traf1P39428 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Traf1P39428 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Traf1P39428 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Traf1P39428 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Traf1P39428 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Traf1P39428 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Traf1P39428 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Traf1P39428 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Traf1P39428 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Traf1P39428 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Traf1P39428 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Traf1P39428 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Traf1P39428 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Traf1P39428 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Traf1P39428 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Traf1P39428 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Traf1P39428 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Traf1P39428 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Traf1P39428 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Traf1P39428 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Traf1P39428 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Traf1P39428 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Traf1P39428 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Traf1P39428 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Traf1P39428 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Traf1P39428 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Traf1P39428 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Traf1P39428 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Traf1P39428 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Traf1P39428 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Traf1P39428 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Traf1P39428 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Traf1P39428 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Traf1P39428 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Traf1P39428 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Traf1P39428 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Traf1P39428 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Traf1P39428 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Traf1P39428 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Traf1P39428 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Traf1P39428 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Traf1P39428 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Traf1P39428 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Traf1P39428 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Traf1P39428 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Traf1P39428 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Traf1P39428 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Traf1P39428 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Traf1P39428 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Traf1P39428 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Traf1P39428 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Traf1P39428 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Traf1P39428 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Traf1P39428 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Traf1P39428 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Traf1P39428 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Traf1P39428 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Traf1P39428 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Traf1P39428 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Traf1P39428 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Traf1P39428 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Traf1P39428 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Traf1P39428 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Traf1P39428 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Traf1P39428 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Traf1P39428 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Traf1P39428 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Traf1P39428 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Traf1P39428 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Traf1P39428 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Traf1P39428 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Traf1P39428 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Traf1P39428 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Traf1P39428 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Traf1P39428 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Traf1P39428 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Traf1P39428 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Traf1P39428 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Traf1P39428 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms