Protein–RNA interactions for Protein: P35329

Cd22, B-cell receptor CD22, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd22P35329 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cd22P35329 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cd22P35329 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cd22P35329 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cd22P35329 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cd22P35329 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cd22P35329 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cd22P35329 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cd22P35329 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cd22P35329 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cd22P35329 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cd22P35329 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cd22P35329 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cd22P35329 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cd22P35329 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cd22P35329 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cd22P35329 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cd22P35329 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Cd22P35329 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cd22P35329 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cd22P35329 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cd22P35329 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Cd22P35329 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cd22P35329 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cd22P35329 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cd22P35329 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cd22P35329 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cd22P35329 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cd22P35329 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cd22P35329 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cd22P35329 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Cd22P35329 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cd22P35329 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cd22P35329 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cd22P35329 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cd22P35329 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cd22P35329 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cd22P35329 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cd22P35329 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cd22P35329 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cd22P35329 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cd22P35329 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cd22P35329 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cd22P35329 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Cd22P35329 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cd22P35329 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cd22P35329 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cd22P35329 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cd22P35329 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cd22P35329 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cd22P35329 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Cd22P35329 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cd22P35329 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cd22P35329 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cd22P35329 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cd22P35329 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cd22P35329 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cd22P35329 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cd22P35329 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cd22P35329 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cd22P35329 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Cd22P35329 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cd22P35329 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cd22P35329 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cd22P35329 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Cd22P35329 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cd22P35329 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cd22P35329 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cd22P35329 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cd22P35329 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cd22P35329 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cd22P35329 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cd22P35329 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cd22P35329 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cd22P35329 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cd22P35329 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cd22P35329 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cd22P35329 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cd22P35329 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cd22P35329 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cd22P35329 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cd22P35329 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cd22P35329 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cd22P35329 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cd22P35329 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cd22P35329 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cd22P35329 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cd22P35329 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cd22P35329 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cd22P35329 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cd22P35329 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cd22P35329 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Cd22P35329 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cd22P35329 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cd22P35329 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cd22P35329 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cd22P35329 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cd22P35329 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cd22P35329 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cd22P35329 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms