Protein–RNA interactions for Protein: P33609

Pola1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola1P33609 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Pola1P33609 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Pola1P33609 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Pola1P33609 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Pola1P33609 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Pola1P33609 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Pola1P33609 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Pola1P33609 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Pola1P33609 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Pola1P33609 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Pola1P33609 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Pola1P33609 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Pola1P33609 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Pola1P33609 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Pola1P33609 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Pola1P33609 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Pola1P33609 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Pola1P33609 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Pola1P33609 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Pola1P33609 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Pola1P33609 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Pola1P33609 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Pola1P33609 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Pola1P33609 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Pola1P33609 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Pola1P33609 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Pola1P33609 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Pola1P33609 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Pola1P33609 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Pola1P33609 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Pola1P33609 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Pola1P33609 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Pola1P33609 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Pola1P33609 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Pola1P33609 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Pola1P33609 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Pola1P33609 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Pola1P33609 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Pola1P33609 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Pola1P33609 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Pola1P33609 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Pola1P33609 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Pola1P33609 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Pola1P33609 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Pola1P33609 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Pola1P33609 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Pola1P33609 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Pola1P33609 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Pola1P33609 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Pola1P33609 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Pola1P33609 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Pola1P33609 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Pola1P33609 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Pola1P33609 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Pola1P33609 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Pola1P33609 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Pola1P33609 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Pola1P33609 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Pola1P33609 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Pola1P33609 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Pola1P33609 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Pola1P33609 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Pola1P33609 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Pola1P33609 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Pola1P33609 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Pola1P33609 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Pola1P33609 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Pola1P33609 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Pola1P33609 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Pola1P33609 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Pola1P33609 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Pola1P33609 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Pola1P33609 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Pola1P33609 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Pola1P33609 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Pola1P33609 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Pola1P33609 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Pola1P33609 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Pola1P33609 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Pola1P33609 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Pola1P33609 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Pola1P33609 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Pola1P33609 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Pola1P33609 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Pola1P33609 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Pola1P33609 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Pola1P33609 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Pola1P33609 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Pola1P33609 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Pola1P33609 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Pola1P33609 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Pola1P33609 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Pola1P33609 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Pola1P33609 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Pola1P33609 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Pola1P33609 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Pola1P33609 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Pola1P33609 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Pola1P33609 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Pola1P33609 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms