Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxc5P32043 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxc5P32043 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxc5P32043 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxc5P32043 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxc5P32043 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxc5P32043 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxc5P32043 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxc5P32043 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxc5P32043 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxc5P32043 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxc5P32043 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxc5P32043 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxc5P32043 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxc5P32043 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxc5P32043 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxc5P32043 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxc5P32043 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxc5P32043 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxc5P32043 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxc5P32043 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxc5P32043 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxc5P32043 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxc5P32043 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxc5P32043 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxc5P32043 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxc5P32043 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxc5P32043 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxc5P32043 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxc5P32043 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxc5P32043 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxc5P32043 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxc5P32043 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxc5P32043 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxc5P32043 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxc5P32043 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxc5P32043 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxc5P32043 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxc5P32043 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxc5P32043 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxc5P32043 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxc5P32043 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxc5P32043 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxc5P32043 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxc5P32043 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxc5P32043 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxc5P32043 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hoxc5P32043 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hoxc5P32043 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hoxc5P32043 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hoxc5P32043 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxc5P32043 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxc5P32043 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxc5P32043 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxc5P32043 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxc5P32043 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxc5P32043 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxc5P32043 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxc5P32043 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxc5P32043 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxc5P32043 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxc5P32043 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxc5P32043 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxc5P32043 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxc5P32043 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxc5P32043 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxc5P32043 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxc5P32043 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxc5P32043 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxc5P32043 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxc5P32043 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxc5P32043 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxc5P32043 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxc5P32043 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxc5P32043 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxc5P32043 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxc5P32043 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxc5P32043 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxc5P32043 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxc5P32043 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxc5P32043 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxc5P32043 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxc5P32043 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxc5P32043 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxc5P32043 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxc5P32043 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxc5P32043 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxc5P32043 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxc5P32043 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxc5P32043 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxc5P32043 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxc5P32043 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxc5P32043 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxc5P32043 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxc5P32043 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxc5P32043 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxc5P32043 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxc5P32043 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxc5P32043 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxc5P32043 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms