Protein–RNA interactions for Protein: P29533

Vcam1, Vascular cell adhesion protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vcam1P29533 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vcam1P29533 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vcam1P29533 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vcam1P29533 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vcam1P29533 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vcam1P29533 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vcam1P29533 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vcam1P29533 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vcam1P29533 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vcam1P29533 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vcam1P29533 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vcam1P29533 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vcam1P29533 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vcam1P29533 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vcam1P29533 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vcam1P29533 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vcam1P29533 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vcam1P29533 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vcam1P29533 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vcam1P29533 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vcam1P29533 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vcam1P29533 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vcam1P29533 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vcam1P29533 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vcam1P29533 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vcam1P29533 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Vcam1P29533 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vcam1P29533 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vcam1P29533 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vcam1P29533 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Vcam1P29533 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vcam1P29533 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vcam1P29533 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vcam1P29533 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vcam1P29533 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vcam1P29533 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vcam1P29533 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vcam1P29533 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vcam1P29533 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Vcam1P29533 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vcam1P29533 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vcam1P29533 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vcam1P29533 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vcam1P29533 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vcam1P29533 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vcam1P29533 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vcam1P29533 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vcam1P29533 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vcam1P29533 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vcam1P29533 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vcam1P29533 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vcam1P29533 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vcam1P29533 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vcam1P29533 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vcam1P29533 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vcam1P29533 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vcam1P29533 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vcam1P29533 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vcam1P29533 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Vcam1P29533 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Vcam1P29533 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vcam1P29533 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vcam1P29533 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vcam1P29533 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vcam1P29533 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vcam1P29533 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vcam1P29533 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vcam1P29533 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Vcam1P29533 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vcam1P29533 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vcam1P29533 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vcam1P29533 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vcam1P29533 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vcam1P29533 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Vcam1P29533 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vcam1P29533 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vcam1P29533 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vcam1P29533 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vcam1P29533 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vcam1P29533 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vcam1P29533 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vcam1P29533 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vcam1P29533 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vcam1P29533 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vcam1P29533 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vcam1P29533 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Vcam1P29533 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Vcam1P29533 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Vcam1P29533 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vcam1P29533 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vcam1P29533 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vcam1P29533 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vcam1P29533 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vcam1P29533 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vcam1P29533 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vcam1P29533 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vcam1P29533 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vcam1P29533 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vcam1P29533 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vcam1P29533 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms