Protein–RNA interactions for Protein: P29037

Tbp, TATA-box-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TbpP29037 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TbpP29037 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TbpP29037 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TbpP29037 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TbpP29037 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TbpP29037 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TbpP29037 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TbpP29037 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TbpP29037 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TbpP29037 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TbpP29037 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TbpP29037 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TbpP29037 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TbpP29037 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TbpP29037 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TbpP29037 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TbpP29037 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TbpP29037 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TbpP29037 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TbpP29037 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TbpP29037 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TbpP29037 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TbpP29037 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TbpP29037 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TbpP29037 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TbpP29037 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TbpP29037 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TbpP29037 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TbpP29037 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TbpP29037 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TbpP29037 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TbpP29037 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TbpP29037 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TbpP29037 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TbpP29037 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TbpP29037 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TbpP29037 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TbpP29037 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TbpP29037 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TbpP29037 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TbpP29037 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TbpP29037 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TbpP29037 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TbpP29037 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TbpP29037 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TbpP29037 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TbpP29037 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TbpP29037 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TbpP29037 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TbpP29037 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TbpP29037 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TbpP29037 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TbpP29037 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TbpP29037 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TbpP29037 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TbpP29037 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TbpP29037 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TbpP29037 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TbpP29037 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TbpP29037 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TbpP29037 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TbpP29037 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TbpP29037 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TbpP29037 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TbpP29037 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TbpP29037 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TbpP29037 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TbpP29037 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TbpP29037 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TbpP29037 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TbpP29037 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TbpP29037 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TbpP29037 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TbpP29037 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TbpP29037 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TbpP29037 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TbpP29037 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TbpP29037 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TbpP29037 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TbpP29037 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TbpP29037 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TbpP29037 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TbpP29037 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TbpP29037 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TbpP29037 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TbpP29037 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TbpP29037 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TbpP29037 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TbpP29037 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TbpP29037 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TbpP29037 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TbpP29037 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TbpP29037 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TbpP29037 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TbpP29037 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TbpP29037 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TbpP29037 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TbpP29037 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TbpP29037 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TbpP29037 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms