Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NapbP28663 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NapbP28663 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NapbP28663 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NapbP28663 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NapbP28663 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NapbP28663 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NapbP28663 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NapbP28663 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NapbP28663 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NapbP28663 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NapbP28663 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NapbP28663 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NapbP28663 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NapbP28663 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NapbP28663 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NapbP28663 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NapbP28663 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NapbP28663 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NapbP28663 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NapbP28663 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NapbP28663 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NapbP28663 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NapbP28663 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NapbP28663 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NapbP28663 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NapbP28663 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NapbP28663 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NapbP28663 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NapbP28663 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NapbP28663 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NapbP28663 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NapbP28663 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NapbP28663 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NapbP28663 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NapbP28663 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NapbP28663 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NapbP28663 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NapbP28663 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NapbP28663 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NapbP28663 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NapbP28663 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NapbP28663 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NapbP28663 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NapbP28663 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NapbP28663 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NapbP28663 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NapbP28663 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NapbP28663 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NapbP28663 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NapbP28663 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NapbP28663 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NapbP28663 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NapbP28663 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NapbP28663 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
NapbP28663 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NapbP28663 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NapbP28663 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NapbP28663 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NapbP28663 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NapbP28663 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NapbP28663 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NapbP28663 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NapbP28663 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NapbP28663 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NapbP28663 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NapbP28663 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NapbP28663 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NapbP28663 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NapbP28663 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NapbP28663 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NapbP28663 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NapbP28663 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NapbP28663 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NapbP28663 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NapbP28663 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NapbP28663 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NapbP28663 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NapbP28663 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NapbP28663 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NapbP28663 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NapbP28663 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NapbP28663 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NapbP28663 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NapbP28663 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NapbP28663 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NapbP28663 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NapbP28663 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NapbP28663 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NapbP28663 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NapbP28663 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NapbP28663 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NapbP28663 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NapbP28663 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NapbP28663 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NapbP28663 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NapbP28663 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NapbP28663 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NapbP28663 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NapbP28663 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms