Protein–RNA interactions for Protein: P28651

Ca8, Carbonic anhydrase-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ca8P28651 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ca8P28651 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ca8P28651 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ca8P28651 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ca8P28651 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ca8P28651 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ca8P28651 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ca8P28651 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ca8P28651 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ca8P28651 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ca8P28651 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ca8P28651 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ca8P28651 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ca8P28651 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ca8P28651 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ca8P28651 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ca8P28651 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ca8P28651 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ca8P28651 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ca8P28651 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ca8P28651 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ca8P28651 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ca8P28651 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ca8P28651 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ca8P28651 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ca8P28651 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ca8P28651 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ca8P28651 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ca8P28651 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ca8P28651 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ca8P28651 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ca8P28651 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ca8P28651 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ca8P28651 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ca8P28651 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ca8P28651 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ca8P28651 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ca8P28651 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ca8P28651 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ca8P28651 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ca8P28651 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ca8P28651 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ca8P28651 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ca8P28651 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ca8P28651 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ca8P28651 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ca8P28651 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ca8P28651 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ca8P28651 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ca8P28651 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ca8P28651 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ca8P28651 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ca8P28651 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ca8P28651 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ca8P28651 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ca8P28651 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ca8P28651 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ca8P28651 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ca8P28651 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ca8P28651 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ca8P28651 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ca8P28651 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ca8P28651 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ca8P28651 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ca8P28651 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ca8P28651 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ca8P28651 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ca8P28651 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ca8P28651 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ca8P28651 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ca8P28651 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ca8P28651 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ca8P28651 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ca8P28651 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ca8P28651 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ca8P28651 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ca8P28651 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ca8P28651 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ca8P28651 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ca8P28651 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ca8P28651 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ca8P28651 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ca8P28651 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ca8P28651 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ca8P28651 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ca8P28651 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ca8P28651 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ca8P28651 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ca8P28651 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ca8P28651 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ca8P28651 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ca8P28651 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ca8P28651 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ca8P28651 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ca8P28651 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ca8P28651 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ca8P28651 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ca8P28651 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ca8P28651 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ca8P28651 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms