Protein–RNA interactions for Protein: P28474

Adh5, Alcohol dehydrogenase class-3, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Adh5P28474 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Adh5P28474 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Adh5P28474 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Adh5P28474 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Adh5P28474 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Adh5P28474 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Adh5P28474 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Adh5P28474 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Adh5P28474 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Adh5P28474 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Adh5P28474 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Adh5P28474 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Adh5P28474 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Adh5P28474 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Adh5P28474 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Adh5P28474 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Adh5P28474 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Adh5P28474 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Adh5P28474 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Adh5P28474 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Adh5P28474 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Adh5P28474 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Adh5P28474 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Adh5P28474 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Adh5P28474 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Adh5P28474 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Adh5P28474 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Adh5P28474 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Adh5P28474 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Adh5P28474 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Adh5P28474 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Adh5P28474 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Adh5P28474 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Adh5P28474 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Adh5P28474 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Adh5P28474 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Adh5P28474 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Adh5P28474 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Adh5P28474 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Adh5P28474 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Adh5P28474 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Adh5P28474 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Adh5P28474 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Adh5P28474 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Adh5P28474 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Adh5P28474 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Adh5P28474 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Adh5P28474 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Adh5P28474 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Adh5P28474 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Adh5P28474 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Adh5P28474 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Adh5P28474 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Adh5P28474 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Adh5P28474 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Adh5P28474 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Adh5P28474 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Adh5P28474 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Adh5P28474 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Adh5P28474 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Adh5P28474 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Adh5P28474 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Adh5P28474 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Adh5P28474 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Adh5P28474 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Adh5P28474 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Adh5P28474 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Adh5P28474 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Adh5P28474 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Adh5P28474 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Adh5P28474 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Adh5P28474 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Adh5P28474 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Adh5P28474 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Adh5P28474 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Adh5P28474 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Adh5P28474 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Adh5P28474 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Adh5P28474 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Adh5P28474 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Adh5P28474 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Adh5P28474 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Adh5P28474 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Adh5P28474 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Adh5P28474 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Adh5P28474 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Adh5P28474 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Adh5P28474 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Adh5P28474 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Adh5P28474 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Adh5P28474 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Adh5P28474 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Adh5P28474 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Adh5P28474 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Adh5P28474 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Adh5P28474 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Adh5P28474 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Adh5P28474 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Adh5P28474 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Adh5P28474 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.3 ms