Protein–RNA interactions for Protein: P26516

Psmd7, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd7P26516 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Psmd7P26516 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Psmd7P26516 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Psmd7P26516 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Psmd7P26516 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Psmd7P26516 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Psmd7P26516 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Psmd7P26516 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Psmd7P26516 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Psmd7P26516 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psmd7P26516 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psmd7P26516 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psmd7P26516 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Psmd7P26516 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psmd7P26516 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Psmd7P26516 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Psmd7P26516 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Psmd7P26516 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Psmd7P26516 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Psmd7P26516 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Psmd7P26516 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Psmd7P26516 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Psmd7P26516 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Psmd7P26516 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Psmd7P26516 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Psmd7P26516 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Psmd7P26516 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Psmd7P26516 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Psmd7P26516 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Psmd7P26516 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Psmd7P26516 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Psmd7P26516 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Psmd7P26516 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Psmd7P26516 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Psmd7P26516 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psmd7P26516 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psmd7P26516 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psmd7P26516 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psmd7P26516 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psmd7P26516 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psmd7P26516 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psmd7P26516 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psmd7P26516 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psmd7P26516 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psmd7P26516 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psmd7P26516 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psmd7P26516 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psmd7P26516 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psmd7P26516 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psmd7P26516 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psmd7P26516 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psmd7P26516 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psmd7P26516 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psmd7P26516 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psmd7P26516 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psmd7P26516 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Psmd7P26516 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psmd7P26516 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psmd7P26516 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psmd7P26516 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psmd7P26516 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psmd7P26516 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psmd7P26516 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psmd7P26516 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psmd7P26516 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psmd7P26516 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psmd7P26516 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psmd7P26516 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psmd7P26516 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psmd7P26516 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psmd7P26516 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psmd7P26516 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psmd7P26516 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psmd7P26516 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psmd7P26516 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psmd7P26516 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psmd7P26516 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psmd7P26516 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psmd7P26516 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psmd7P26516 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psmd7P26516 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psmd7P26516 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psmd7P26516 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psmd7P26516 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psmd7P26516 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psmd7P26516 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psmd7P26516 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psmd7P26516 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psmd7P26516 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psmd7P26516 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psmd7P26516 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psmd7P26516 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psmd7P26516 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psmd7P26516 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psmd7P26516 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psmd7P26516 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psmd7P26516 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Psmd7P26516 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psmd7P26516 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psmd7P26516 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms