Protein–RNA interactions for Protein: P25918

Cd19, B-lymphocyte antigen CD19, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd19P25918 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd19P25918 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd19P25918 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cd19P25918 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cd19P25918 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cd19P25918 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cd19P25918 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cd19P25918 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cd19P25918 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cd19P25918 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cd19P25918 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cd19P25918 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cd19P25918 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cd19P25918 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cd19P25918 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cd19P25918 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cd19P25918 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cd19P25918 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cd19P25918 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cd19P25918 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cd19P25918 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cd19P25918 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cd19P25918 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cd19P25918 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cd19P25918 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Cd19P25918 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cd19P25918 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Cd19P25918 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cd19P25918 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cd19P25918 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cd19P25918 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cd19P25918 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Cd19P25918 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cd19P25918 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Cd19P25918 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cd19P25918 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cd19P25918 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cd19P25918 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Cd19P25918 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cd19P25918 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cd19P25918 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cd19P25918 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cd19P25918 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cd19P25918 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cd19P25918 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cd19P25918 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cd19P25918 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cd19P25918 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cd19P25918 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cd19P25918 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cd19P25918 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Cd19P25918 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cd19P25918 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd19P25918 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd19P25918 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd19P25918 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd19P25918 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd19P25918 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd19P25918 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd19P25918 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd19P25918 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd19P25918 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd19P25918 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd19P25918 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd19P25918 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd19P25918 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd19P25918 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd19P25918 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd19P25918 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd19P25918 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd19P25918 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd19P25918 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd19P25918 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd19P25918 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd19P25918 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd19P25918 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd19P25918 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd19P25918 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd19P25918 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd19P25918 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd19P25918 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd19P25918 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd19P25918 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd19P25918 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd19P25918 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd19P25918 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd19P25918 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd19P25918 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd19P25918 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd19P25918 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd19P25918 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd19P25918 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd19P25918 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd19P25918 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd19P25918 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd19P25918 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd19P25918 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd19P25918 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd19P25918 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd19P25918 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms