Protein–RNA interactions for Protein: P22387

Edn1, Endothelin-1, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edn1P22387 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edn1P22387 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edn1P22387 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edn1P22387 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edn1P22387 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Edn1P22387 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Edn1P22387 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Edn1P22387 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Edn1P22387 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Edn1P22387 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Edn1P22387 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Edn1P22387 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Edn1P22387 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Edn1P22387 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Edn1P22387 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Edn1P22387 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Edn1P22387 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Edn1P22387 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Edn1P22387 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Edn1P22387 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Edn1P22387 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Edn1P22387 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Edn1P22387 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Edn1P22387 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Edn1P22387 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Edn1P22387 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Edn1P22387 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Edn1P22387 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Edn1P22387 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Edn1P22387 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Edn1P22387 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Edn1P22387 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Edn1P22387 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Edn1P22387 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Edn1P22387 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Edn1P22387 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Edn1P22387 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Edn1P22387 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Edn1P22387 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Edn1P22387 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Edn1P22387 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Edn1P22387 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Edn1P22387 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Edn1P22387 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Edn1P22387 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Edn1P22387 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Edn1P22387 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Edn1P22387 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Edn1P22387 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Edn1P22387 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Edn1P22387 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Edn1P22387 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Edn1P22387 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Edn1P22387 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Edn1P22387 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Edn1P22387 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Edn1P22387 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Edn1P22387 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Edn1P22387 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Edn1P22387 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Edn1P22387 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Edn1P22387 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Edn1P22387 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Edn1P22387 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Edn1P22387 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Edn1P22387 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Edn1P22387 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Edn1P22387 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edn1P22387 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edn1P22387 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edn1P22387 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edn1P22387 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edn1P22387 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Edn1P22387 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edn1P22387 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edn1P22387 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Edn1P22387 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Edn1P22387 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Edn1P22387 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Edn1P22387 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Edn1P22387 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Edn1P22387 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Edn1P22387 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Edn1P22387 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edn1P22387 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edn1P22387 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edn1P22387 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edn1P22387 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edn1P22387 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edn1P22387 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Edn1P22387 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Edn1P22387 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Edn1P22387 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edn1P22387 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edn1P22387 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edn1P22387 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edn1P22387 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edn1P22387 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edn1P22387 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Edn1P22387 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms