Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ms4a2P20490 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ms4a2P20490 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ms4a2P20490 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ms4a2P20490 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ms4a2P20490 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ms4a2P20490 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ms4a2P20490 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ms4a2P20490 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ms4a2P20490 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ms4a2P20490 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ms4a2P20490 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ms4a2P20490 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ms4a2P20490 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ms4a2P20490 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ms4a2P20490 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ms4a2P20490 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ms4a2P20490 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ms4a2P20490 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ms4a2P20490 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ms4a2P20490 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ms4a2P20490 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ms4a2P20490 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ms4a2P20490 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ms4a2P20490 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Ms4a2P20490 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Ms4a2P20490 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ms4a2P20490 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ms4a2P20490 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ms4a2P20490 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ms4a2P20490 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ms4a2P20490 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ms4a2P20490 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ms4a2P20490 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ms4a2P20490 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ms4a2P20490 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ms4a2P20490 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ms4a2P20490 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ms4a2P20490 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ms4a2P20490 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ms4a2P20490 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ms4a2P20490 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ms4a2P20490 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ms4a2P20490 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ms4a2P20490 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ms4a2P20490 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ms4a2P20490 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ms4a2P20490 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ms4a2P20490 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ms4a2P20490 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ms4a2P20490 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ms4a2P20490 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ms4a2P20490 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ms4a2P20490 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ms4a2P20490 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ms4a2P20490 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ms4a2P20490 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ms4a2P20490 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ms4a2P20490 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ms4a2P20490 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ms4a2P20490 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ms4a2P20490 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ms4a2P20490 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ms4a2P20490 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ms4a2P20490 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ms4a2P20490 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ms4a2P20490 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ms4a2P20490 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ms4a2P20490 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ms4a2P20490 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ms4a2P20490 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ms4a2P20490 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ms4a2P20490 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ms4a2P20490 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ms4a2P20490 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ms4a2P20490 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ms4a2P20490 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ms4a2P20490 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ms4a2P20490 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ms4a2P20490 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ms4a2P20490 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ms4a2P20490 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ms4a2P20490 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ms4a2P20490 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ms4a2P20490 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ms4a2P20490 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ms4a2P20490 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ms4a2P20490 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ms4a2P20490 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ms4a2P20490 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ms4a2P20490 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ms4a2P20490 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ms4a2P20490 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ms4a2P20490 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ms4a2P20490 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Ms4a2P20490 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Ms4a2P20490 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ms4a2P20490 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ms4a2P20490 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ms4a2P20490 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms