Protein–RNA interactions for Protein: P20352

F3, Tissue factor, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F3P20352 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
F3P20352 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
F3P20352 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.31■■□□□ 1
F3P20352 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
F3P20352 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.31■■□□□ 1
F3P20352 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
F3P20352 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
F3P20352 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
F3P20352 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
F3P20352 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
F3P20352 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
F3P20352 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
F3P20352 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
F3P20352 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
F3P20352 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
F3P20352 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
F3P20352 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
F3P20352 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
F3P20352 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
F3P20352 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
F3P20352 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
F3P20352 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
F3P20352 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
F3P20352 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
F3P20352 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
F3P20352 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
F3P20352 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
F3P20352 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
F3P20352 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
F3P20352 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
F3P20352 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
F3P20352 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
F3P20352 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
F3P20352 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
F3P20352 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
F3P20352 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
F3P20352 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
F3P20352 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
F3P20352 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
F3P20352 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
F3P20352 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
F3P20352 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
F3P20352 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
F3P20352 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
F3P20352 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
F3P20352 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
F3P20352 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
F3P20352 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
F3P20352 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
F3P20352 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
F3P20352 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
F3P20352 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
F3P20352 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
F3P20352 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
F3P20352 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
F3P20352 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
F3P20352 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
F3P20352 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
F3P20352 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
F3P20352 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
F3P20352 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
F3P20352 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
F3P20352 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
F3P20352 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
F3P20352 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
F3P20352 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
F3P20352 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
F3P20352 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
F3P20352 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
F3P20352 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
F3P20352 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
F3P20352 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
F3P20352 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
F3P20352 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
F3P20352 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
F3P20352 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
F3P20352 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
F3P20352 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
F3P20352 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
F3P20352 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
F3P20352 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
F3P20352 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
F3P20352 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
F3P20352 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
F3P20352 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
F3P20352 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
F3P20352 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
F3P20352 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
F3P20352 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
F3P20352 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
F3P20352 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
F3P20352 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
F3P20352 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
F3P20352 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
F3P20352 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
F3P20352 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
F3P20352 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
F3P20352 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
F3P20352 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
F3P20352 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms