Protein–RNA interactions for Protein: P18654

Rps6ka3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka3P18654 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rps6ka3P18654 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rps6ka3P18654 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rps6ka3P18654 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rps6ka3P18654 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rps6ka3P18654 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rps6ka3P18654 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rps6ka3P18654 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rps6ka3P18654 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rps6ka3P18654 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rps6ka3P18654 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rps6ka3P18654 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rps6ka3P18654 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rps6ka3P18654 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rps6ka3P18654 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Rps6ka3P18654 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rps6ka3P18654 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rps6ka3P18654 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rps6ka3P18654 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rps6ka3P18654 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rps6ka3P18654 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rps6ka3P18654 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rps6ka3P18654 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rps6ka3P18654 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rps6ka3P18654 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rps6ka3P18654 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rps6ka3P18654 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rps6ka3P18654 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rps6ka3P18654 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rps6ka3P18654 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rps6ka3P18654 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rps6ka3P18654 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rps6ka3P18654 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rps6ka3P18654 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rps6ka3P18654 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rps6ka3P18654 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rps6ka3P18654 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rps6ka3P18654 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rps6ka3P18654 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rps6ka3P18654 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rps6ka3P18654 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rps6ka3P18654 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Rps6ka3P18654 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rps6ka3P18654 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rps6ka3P18654 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rps6ka3P18654 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rps6ka3P18654 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rps6ka3P18654 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rps6ka3P18654 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rps6ka3P18654 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rps6ka3P18654 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rps6ka3P18654 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rps6ka3P18654 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rps6ka3P18654 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Rps6ka3P18654 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Rps6ka3P18654 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rps6ka3P18654 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Rps6ka3P18654 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rps6ka3P18654 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rps6ka3P18654 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rps6ka3P18654 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rps6ka3P18654 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rps6ka3P18654 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rps6ka3P18654 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rps6ka3P18654 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rps6ka3P18654 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rps6ka3P18654 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rps6ka3P18654 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rps6ka3P18654 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rps6ka3P18654 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rps6ka3P18654 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rps6ka3P18654 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rps6ka3P18654 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rps6ka3P18654 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rps6ka3P18654 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rps6ka3P18654 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rps6ka3P18654 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Rps6ka3P18654 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rps6ka3P18654 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rps6ka3P18654 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rps6ka3P18654 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rps6ka3P18654 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rps6ka3P18654 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rps6ka3P18654 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Rps6ka3P18654 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rps6ka3P18654 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rps6ka3P18654 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rps6ka3P18654 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rps6ka3P18654 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps6ka3P18654 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps6ka3P18654 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps6ka3P18654 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps6ka3P18654 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps6ka3P18654 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps6ka3P18654 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps6ka3P18654 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps6ka3P18654 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps6ka3P18654 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rps6ka3P18654 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Rps6ka3P18654 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms