Protein–RNA interactions for Protein: P18340

Cxcl9, C-X-C motif chemokine 9, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl9P18340 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cxcl9P18340 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Cxcl9P18340 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cxcl9P18340 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cxcl9P18340 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cxcl9P18340 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cxcl9P18340 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cxcl9P18340 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cxcl9P18340 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cxcl9P18340 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cxcl9P18340 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cxcl9P18340 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cxcl9P18340 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cxcl9P18340 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cxcl9P18340 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cxcl9P18340 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cxcl9P18340 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cxcl9P18340 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cxcl9P18340 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cxcl9P18340 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cxcl9P18340 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Cxcl9P18340 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cxcl9P18340 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cxcl9P18340 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cxcl9P18340 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cxcl9P18340 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cxcl9P18340 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cxcl9P18340 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cxcl9P18340 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cxcl9P18340 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cxcl9P18340 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cxcl9P18340 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cxcl9P18340 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cxcl9P18340 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cxcl9P18340 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cxcl9P18340 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cxcl9P18340 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cxcl9P18340 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cxcl9P18340 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cxcl9P18340 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cxcl9P18340 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cxcl9P18340 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cxcl9P18340 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cxcl9P18340 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cxcl9P18340 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cxcl9P18340 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cxcl9P18340 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cxcl9P18340 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cxcl9P18340 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cxcl9P18340 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cxcl9P18340 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Cxcl9P18340 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cxcl9P18340 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cxcl9P18340 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cxcl9P18340 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cxcl9P18340 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cxcl9P18340 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Cxcl9P18340 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cxcl9P18340 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cxcl9P18340 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cxcl9P18340 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cxcl9P18340 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cxcl9P18340 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cxcl9P18340 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cxcl9P18340 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cxcl9P18340 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cxcl9P18340 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cxcl9P18340 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cxcl9P18340 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cxcl9P18340 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cxcl9P18340 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Cxcl9P18340 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Cxcl9P18340 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cxcl9P18340 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cxcl9P18340 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cxcl9P18340 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cxcl9P18340 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cxcl9P18340 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Cxcl9P18340 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cxcl9P18340 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cxcl9P18340 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cxcl9P18340 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cxcl9P18340 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cxcl9P18340 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cxcl9P18340 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cxcl9P18340 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cxcl9P18340 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cxcl9P18340 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cxcl9P18340 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cxcl9P18340 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Cxcl9P18340 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cxcl9P18340 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cxcl9P18340 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cxcl9P18340 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cxcl9P18340 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cxcl9P18340 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cxcl9P18340 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cxcl9P18340 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Cxcl9P18340 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cxcl9P18340 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms