Protein–RNA interactions for Protein: P17679

Gata1, Erythroid transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata1P17679 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gata1P17679 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gata1P17679 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gata1P17679 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gata1P17679 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gata1P17679 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gata1P17679 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gata1P17679 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gata1P17679 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gata1P17679 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gata1P17679 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gata1P17679 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gata1P17679 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gata1P17679 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gata1P17679 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gata1P17679 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gata1P17679 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gata1P17679 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gata1P17679 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gata1P17679 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gata1P17679 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gata1P17679 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gata1P17679 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gata1P17679 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gata1P17679 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gata1P17679 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gata1P17679 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gata1P17679 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gata1P17679 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gata1P17679 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gata1P17679 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gata1P17679 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gata1P17679 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gata1P17679 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gata1P17679 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gata1P17679 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gata1P17679 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gata1P17679 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gata1P17679 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gata1P17679 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gata1P17679 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gata1P17679 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gata1P17679 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gata1P17679 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gata1P17679 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gata1P17679 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gata1P17679 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gata1P17679 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gata1P17679 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gata1P17679 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gata1P17679 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gata1P17679 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gata1P17679 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gata1P17679 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gata1P17679 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gata1P17679 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gata1P17679 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gata1P17679 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gata1P17679 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gata1P17679 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gata1P17679 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gata1P17679 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gata1P17679 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gata1P17679 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gata1P17679 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gata1P17679 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gata1P17679 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gata1P17679 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gata1P17679 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gata1P17679 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gata1P17679 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gata1P17679 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gata1P17679 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gata1P17679 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gata1P17679 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gata1P17679 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gata1P17679 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gata1P17679 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gata1P17679 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gata1P17679 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gata1P17679 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gata1P17679 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gata1P17679 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gata1P17679 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gata1P17679 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gata1P17679 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gata1P17679 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gata1P17679 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gata1P17679 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gata1P17679 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gata1P17679 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gata1P17679 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gata1P17679 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gata1P17679 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gata1P17679 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gata1P17679 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gata1P17679 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gata1P17679 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gata1P17679 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gata1P17679 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms