Protein–RNA interactions for Protein: P17563

Selenbp1, Selenium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Selenbp1P17563 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Selenbp1P17563 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Selenbp1P17563 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Selenbp1P17563 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Selenbp1P17563 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Selenbp1P17563 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Selenbp1P17563 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Selenbp1P17563 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Selenbp1P17563 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Selenbp1P17563 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Selenbp1P17563 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Selenbp1P17563 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Selenbp1P17563 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Selenbp1P17563 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Selenbp1P17563 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Selenbp1P17563 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Selenbp1P17563 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Selenbp1P17563 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Selenbp1P17563 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Selenbp1P17563 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Selenbp1P17563 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Selenbp1P17563 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Selenbp1P17563 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Selenbp1P17563 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Selenbp1P17563 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Selenbp1P17563 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Selenbp1P17563 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Selenbp1P17563 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Selenbp1P17563 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Selenbp1P17563 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Selenbp1P17563 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Selenbp1P17563 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Selenbp1P17563 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Selenbp1P17563 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Selenbp1P17563 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Selenbp1P17563 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Selenbp1P17563 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Selenbp1P17563 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Selenbp1P17563 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Selenbp1P17563 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Selenbp1P17563 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Selenbp1P17563 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Selenbp1P17563 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Selenbp1P17563 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Selenbp1P17563 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Selenbp1P17563 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Selenbp1P17563 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Selenbp1P17563 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Selenbp1P17563 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Selenbp1P17563 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Selenbp1P17563 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Selenbp1P17563 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Selenbp1P17563 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Selenbp1P17563 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Selenbp1P17563 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Selenbp1P17563 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Selenbp1P17563 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Selenbp1P17563 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Selenbp1P17563 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Selenbp1P17563 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Selenbp1P17563 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Selenbp1P17563 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Selenbp1P17563 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Selenbp1P17563 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Selenbp1P17563 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Selenbp1P17563 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Selenbp1P17563 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Selenbp1P17563 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Selenbp1P17563 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Selenbp1P17563 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Selenbp1P17563 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Selenbp1P17563 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Selenbp1P17563 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Selenbp1P17563 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Selenbp1P17563 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Selenbp1P17563 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Selenbp1P17563 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Selenbp1P17563 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Selenbp1P17563 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Selenbp1P17563 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Selenbp1P17563 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Selenbp1P17563 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Selenbp1P17563 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Selenbp1P17563 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Selenbp1P17563 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Selenbp1P17563 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Selenbp1P17563 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Selenbp1P17563 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Selenbp1P17563 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Selenbp1P17563 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Selenbp1P17563 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Selenbp1P17563 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Selenbp1P17563 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Selenbp1P17563 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Selenbp1P17563 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Selenbp1P17563 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Selenbp1P17563 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Selenbp1P17563 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Selenbp1P17563 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Selenbp1P17563 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms