Protein–RNA interactions for Protein: P17532

Tph1, Tryptophan 5-hydroxylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tph1P17532 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tph1P17532 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tph1P17532 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tph1P17532 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tph1P17532 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tph1P17532 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tph1P17532 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tph1P17532 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tph1P17532 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tph1P17532 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Tph1P17532 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tph1P17532 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tph1P17532 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tph1P17532 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tph1P17532 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tph1P17532 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tph1P17532 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tph1P17532 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tph1P17532 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tph1P17532 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tph1P17532 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tph1P17532 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tph1P17532 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tph1P17532 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tph1P17532 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tph1P17532 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tph1P17532 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tph1P17532 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tph1P17532 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tph1P17532 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Tph1P17532 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tph1P17532 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tph1P17532 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tph1P17532 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tph1P17532 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tph1P17532 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tph1P17532 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tph1P17532 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tph1P17532 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tph1P17532 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tph1P17532 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tph1P17532 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tph1P17532 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tph1P17532 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Tph1P17532 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tph1P17532 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tph1P17532 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tph1P17532 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tph1P17532 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Tph1P17532 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tph1P17532 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tph1P17532 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tph1P17532 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tph1P17532 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tph1P17532 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Tph1P17532 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tph1P17532 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tph1P17532 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tph1P17532 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tph1P17532 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tph1P17532 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tph1P17532 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tph1P17532 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tph1P17532 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tph1P17532 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tph1P17532 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tph1P17532 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tph1P17532 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tph1P17532 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tph1P17532 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tph1P17532 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tph1P17532 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tph1P17532 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tph1P17532 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tph1P17532 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tph1P17532 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tph1P17532 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tph1P17532 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tph1P17532 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tph1P17532 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tph1P17532 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tph1P17532 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tph1P17532 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tph1P17532 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tph1P17532 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tph1P17532 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tph1P17532 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tph1P17532 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tph1P17532 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tph1P17532 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tph1P17532 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tph1P17532 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tph1P17532 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tph1P17532 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tph1P17532 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tph1P17532 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tph1P17532 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tph1P17532 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tph1P17532 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tph1P17532 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms