Protein–RNA interactions for Protein: P16388

Kcna1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna1P16388 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kcna1P16388 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Kcna1P16388 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Kcna1P16388 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Kcna1P16388 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kcna1P16388 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kcna1P16388 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Kcna1P16388 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Kcna1P16388 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kcna1P16388 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kcna1P16388 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kcna1P16388 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kcna1P16388 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Kcna1P16388 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kcna1P16388 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kcna1P16388 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kcna1P16388 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kcna1P16388 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kcna1P16388 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kcna1P16388 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kcna1P16388 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kcna1P16388 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Kcna1P16388 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kcna1P16388 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kcna1P16388 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kcna1P16388 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kcna1P16388 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kcna1P16388 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kcna1P16388 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kcna1P16388 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Kcna1P16388 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kcna1P16388 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Kcna1P16388 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kcna1P16388 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kcna1P16388 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kcna1P16388 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kcna1P16388 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kcna1P16388 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kcna1P16388 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kcna1P16388 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Kcna1P16388 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kcna1P16388 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Kcna1P16388 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Kcna1P16388 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Kcna1P16388 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Kcna1P16388 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Kcna1P16388 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Kcna1P16388 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Kcna1P16388 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kcna1P16388 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kcna1P16388 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Kcna1P16388 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kcna1P16388 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kcna1P16388 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kcna1P16388 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kcna1P16388 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kcna1P16388 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kcna1P16388 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Kcna1P16388 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kcna1P16388 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kcna1P16388 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kcna1P16388 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kcna1P16388 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Kcna1P16388 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kcna1P16388 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kcna1P16388 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kcna1P16388 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kcna1P16388 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kcna1P16388 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kcna1P16388 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kcna1P16388 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kcna1P16388 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kcna1P16388 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kcna1P16388 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Kcna1P16388 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kcna1P16388 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kcna1P16388 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kcna1P16388 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kcna1P16388 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Kcna1P16388 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kcna1P16388 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kcna1P16388 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kcna1P16388 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kcna1P16388 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kcna1P16388 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kcna1P16388 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kcna1P16388 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kcna1P16388 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kcna1P16388 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kcna1P16388 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kcna1P16388 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kcna1P16388 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kcna1P16388 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kcna1P16388 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kcna1P16388 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kcna1P16388 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kcna1P16388 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kcna1P16388 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kcna1P16388 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kcna1P16388 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 345.2 ms