Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nr4a1P12813 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nr4a1P12813 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nr4a1P12813 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nr4a1P12813 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nr4a1P12813 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nr4a1P12813 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nr4a1P12813 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nr4a1P12813 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nr4a1P12813 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nr4a1P12813 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nr4a1P12813 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Nr4a1P12813 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Nr4a1P12813 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nr4a1P12813 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nr4a1P12813 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nr4a1P12813 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nr4a1P12813 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nr4a1P12813 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Nr4a1P12813 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nr4a1P12813 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nr4a1P12813 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nr4a1P12813 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nr4a1P12813 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nr4a1P12813 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nr4a1P12813 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nr4a1P12813 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nr4a1P12813 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nr4a1P12813 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nr4a1P12813 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nr4a1P12813 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nr4a1P12813 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nr4a1P12813 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nr4a1P12813 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Nr4a1P12813 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nr4a1P12813 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nr4a1P12813 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nr4a1P12813 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nr4a1P12813 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nr4a1P12813 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nr4a1P12813 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nr4a1P12813 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nr4a1P12813 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nr4a1P12813 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nr4a1P12813 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nr4a1P12813 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Nr4a1P12813 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nr4a1P12813 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nr4a1P12813 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nr4a1P12813 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nr4a1P12813 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nr4a1P12813 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nr4a1P12813 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nr4a1P12813 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nr4a1P12813 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nr4a1P12813 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nr4a1P12813 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nr4a1P12813 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nr4a1P12813 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nr4a1P12813 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nr4a1P12813 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nr4a1P12813 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nr4a1P12813 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Nr4a1P12813 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nr4a1P12813 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nr4a1P12813 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nr4a1P12813 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nr4a1P12813 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nr4a1P12813 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nr4a1P12813 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nr4a1P12813 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nr4a1P12813 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nr4a1P12813 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nr4a1P12813 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nr4a1P12813 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nr4a1P12813 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nr4a1P12813 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nr4a1P12813 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nr4a1P12813 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nr4a1P12813 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nr4a1P12813 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nr4a1P12813 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nr4a1P12813 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nr4a1P12813 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nr4a1P12813 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nr4a1P12813 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nr4a1P12813 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nr4a1P12813 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nr4a1P12813 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nr4a1P12813 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nr4a1P12813 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nr4a1P12813 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nr4a1P12813 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nr4a1P12813 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nr4a1P12813 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nr4a1P12813 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nr4a1P12813 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Nr4a1P12813 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nr4a1P12813 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nr4a1P12813 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms