Protein–RNA interactions for Protein: P11688

Itga5, Integrin alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga5P11688 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga5P11688 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga5P11688 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga5P11688 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga5P11688 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga5P11688 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga5P11688 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga5P11688 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga5P11688 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga5P11688 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga5P11688 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Itga5P11688 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Itga5P11688 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Itga5P11688 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Itga5P11688 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Itga5P11688 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Itga5P11688 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Itga5P11688 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Itga5P11688 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Itga5P11688 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Itga5P11688 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Itga5P11688 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Itga5P11688 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Itga5P11688 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Itga5P11688 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Itga5P11688 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Itga5P11688 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Itga5P11688 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Itga5P11688 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Itga5P11688 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Itga5P11688 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Itga5P11688 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Itga5P11688 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Itga5P11688 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Itga5P11688 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Itga5P11688 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Itga5P11688 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Itga5P11688 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Itga5P11688 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Itga5P11688 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Itga5P11688 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Itga5P11688 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Itga5P11688 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Itga5P11688 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Itga5P11688 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Itga5P11688 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Itga5P11688 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Itga5P11688 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Itga5P11688 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Itga5P11688 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Itga5P11688 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Itga5P11688 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Itga5P11688 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Itga5P11688 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Itga5P11688 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Itga5P11688 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Itga5P11688 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Itga5P11688 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Itga5P11688 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Itga5P11688 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Itga5P11688 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Itga5P11688 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Itga5P11688 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Itga5P11688 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Itga5P11688 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Itga5P11688 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Itga5P11688 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Itga5P11688 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Itga5P11688 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Itga5P11688 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Itga5P11688 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Itga5P11688 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Itga5P11688 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Itga5P11688 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Itga5P11688 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Itga5P11688 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Itga5P11688 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Itga5P11688 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Itga5P11688 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Itga5P11688 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Itga5P11688 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Itga5P11688 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Itga5P11688 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Itga5P11688 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Itga5P11688 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Itga5P11688 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Itga5P11688 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Itga5P11688 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Itga5P11688 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Itga5P11688 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Itga5P11688 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Itga5P11688 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Itga5P11688 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Itga5P11688 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Itga5P11688 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Itga5P11688 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Itga5P11688 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Itga5P11688 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Itga5P11688 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Itga5P11688 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms