Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
DmdP11531 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DmdP11531 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
DmdP11531 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DmdP11531 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DmdP11531 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
DmdP11531 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DmdP11531 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DmdP11531 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DmdP11531 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DmdP11531 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DmdP11531 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DmdP11531 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DmdP11531 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DmdP11531 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DmdP11531 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DmdP11531 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DmdP11531 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DmdP11531 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DmdP11531 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DmdP11531 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DmdP11531 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DmdP11531 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DmdP11531 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DmdP11531 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DmdP11531 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DmdP11531 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DmdP11531 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DmdP11531 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DmdP11531 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DmdP11531 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DmdP11531 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DmdP11531 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DmdP11531 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DmdP11531 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DmdP11531 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DmdP11531 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
DmdP11531 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DmdP11531 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DmdP11531 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DmdP11531 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DmdP11531 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
DmdP11531 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DmdP11531 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DmdP11531 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DmdP11531 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
DmdP11531 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DmdP11531 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DmdP11531 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DmdP11531 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DmdP11531 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DmdP11531 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DmdP11531 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
DmdP11531 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DmdP11531 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DmdP11531 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DmdP11531 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DmdP11531 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DmdP11531 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DmdP11531 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DmdP11531 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DmdP11531 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DmdP11531 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DmdP11531 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DmdP11531 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DmdP11531 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DmdP11531 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DmdP11531 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DmdP11531 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DmdP11531 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DmdP11531 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DmdP11531 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DmdP11531 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DmdP11531 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
DmdP11531 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DmdP11531 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DmdP11531 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DmdP11531 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DmdP11531 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DmdP11531 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DmdP11531 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DmdP11531 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DmdP11531 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DmdP11531 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DmdP11531 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DmdP11531 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
DmdP11531 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DmdP11531 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DmdP11531 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DmdP11531 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DmdP11531 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DmdP11531 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DmdP11531 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
DmdP11531 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DmdP11531 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DmdP11531 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
DmdP11531 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DmdP11531 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DmdP11531 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DmdP11531 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms