Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fv4P11370 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fv4P11370 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Fv4P11370 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fv4P11370 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fv4P11370 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fv4P11370 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fv4P11370 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fv4P11370 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fv4P11370 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fv4P11370 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fv4P11370 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fv4P11370 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fv4P11370 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fv4P11370 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fv4P11370 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fv4P11370 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fv4P11370 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fv4P11370 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fv4P11370 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Fv4P11370 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fv4P11370 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fv4P11370 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fv4P11370 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fv4P11370 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fv4P11370 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Fv4P11370 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fv4P11370 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fv4P11370 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fv4P11370 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fv4P11370 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Fv4P11370 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fv4P11370 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fv4P11370 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fv4P11370 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fv4P11370 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fv4P11370 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fv4P11370 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fv4P11370 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fv4P11370 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fv4P11370 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fv4P11370 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fv4P11370 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fv4P11370 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fv4P11370 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fv4P11370 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fv4P11370 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fv4P11370 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Fv4P11370 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fv4P11370 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fv4P11370 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fv4P11370 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fv4P11370 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fv4P11370 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fv4P11370 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fv4P11370 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fv4P11370 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Fv4P11370 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Fv4P11370 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fv4P11370 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fv4P11370 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Fv4P11370 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Fv4P11370 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fv4P11370 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fv4P11370 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fv4P11370 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fv4P11370 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fv4P11370 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fv4P11370 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fv4P11370 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fv4P11370 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fv4P11370 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fv4P11370 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fv4P11370 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fv4P11370 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fv4P11370 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fv4P11370 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Fv4P11370 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fv4P11370 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fv4P11370 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fv4P11370 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Fv4P11370 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Fv4P11370 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fv4P11370 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Fv4P11370 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fv4P11370 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fv4P11370 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fv4P11370 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fv4P11370 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fv4P11370 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fv4P11370 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fv4P11370 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fv4P11370 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fv4P11370 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fv4P11370 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fv4P11370 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fv4P11370 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fv4P11370 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fv4P11370 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fv4P11370 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms