Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PolP11369 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PolP11369 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PolP11369 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PolP11369 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PolP11369 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PolP11369 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PolP11369 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PolP11369 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PolP11369 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PolP11369 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PolP11369 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PolP11369 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PolP11369 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PolP11369 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PolP11369 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PolP11369 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PolP11369 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PolP11369 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PolP11369 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PolP11369 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PolP11369 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PolP11369 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PolP11369 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PolP11369 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PolP11369 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PolP11369 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PolP11369 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PolP11369 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PolP11369 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PolP11369 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PolP11369 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PolP11369 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PolP11369 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PolP11369 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PolP11369 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PolP11369 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PolP11369 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PolP11369 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PolP11369 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PolP11369 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PolP11369 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PolP11369 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PolP11369 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PolP11369 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PolP11369 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PolP11369 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PolP11369 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PolP11369 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PolP11369 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PolP11369 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PolP11369 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PolP11369 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PolP11369 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PolP11369 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PolP11369 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PolP11369 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PolP11369 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PolP11369 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PolP11369 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PolP11369 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PolP11369 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PolP11369 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PolP11369 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PolP11369 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PolP11369 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PolP11369 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PolP11369 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PolP11369 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PolP11369 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PolP11369 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PolP11369 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PolP11369 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PolP11369 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PolP11369 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PolP11369 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PolP11369 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PolP11369 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PolP11369 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PolP11369 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PolP11369 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PolP11369 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PolP11369 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PolP11369 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PolP11369 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PolP11369 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PolP11369 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PolP11369 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PolP11369 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PolP11369 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PolP11369 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PolP11369 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PolP11369 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PolP11369 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PolP11369 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PolP11369 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PolP11369 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PolP11369 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PolP11369 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PolP11369 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms