Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CatspereP0DP43 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CatspereP0DP43 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CatspereP0DP43 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CatspereP0DP43 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CatspereP0DP43 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CatspereP0DP43 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CatspereP0DP43 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CatspereP0DP43 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CatspereP0DP43 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CatspereP0DP43 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CatspereP0DP43 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CatspereP0DP43 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CatspereP0DP43 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CatspereP0DP43 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CatspereP0DP43 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CatspereP0DP43 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CatspereP0DP43 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CatspereP0DP43 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CatspereP0DP43 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CatspereP0DP43 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CatspereP0DP43 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CatspereP0DP43 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CatspereP0DP43 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CatspereP0DP43 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CatspereP0DP43 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CatspereP0DP43 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CatspereP0DP43 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CatspereP0DP43 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CatspereP0DP43 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CatspereP0DP43 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CatspereP0DP43 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CatspereP0DP43 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CatspereP0DP43 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CatspereP0DP43 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CatspereP0DP43 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CatspereP0DP43 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CatspereP0DP43 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CatspereP0DP43 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CatspereP0DP43 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CatspereP0DP43 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CatspereP0DP43 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CatspereP0DP43 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CatspereP0DP43 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CatspereP0DP43 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CatspereP0DP43 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CatspereP0DP43 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CatspereP0DP43 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CatspereP0DP43 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CatspereP0DP43 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CatspereP0DP43 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CatspereP0DP43 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CatspereP0DP43 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CatspereP0DP43 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CatspereP0DP43 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CatspereP0DP43 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CatspereP0DP43 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CatspereP0DP43 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CatspereP0DP43 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CatspereP0DP43 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CatspereP0DP43 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CatspereP0DP43 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CatspereP0DP43 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CatspereP0DP43 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CatspereP0DP43 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CatspereP0DP43 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CatspereP0DP43 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CatspereP0DP43 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CatspereP0DP43 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CatspereP0DP43 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CatspereP0DP43 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CatspereP0DP43 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
CatspereP0DP43 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CatspereP0DP43 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CatspereP0DP43 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CatspereP0DP43 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CatspereP0DP43 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CatspereP0DP43 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CatspereP0DP43 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CatspereP0DP43 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CatspereP0DP43 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CatspereP0DP43 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CatspereP0DP43 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CatspereP0DP43 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CatspereP0DP43 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CatspereP0DP43 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CatspereP0DP43 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CatspereP0DP43 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CatspereP0DP43 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CatspereP0DP43 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CatspereP0DP43 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CatspereP0DP43 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CatspereP0DP43 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CatspereP0DP43 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CatspereP0DP43 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CatspereP0DP43 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CatspereP0DP43 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CatspereP0DP43 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CatspereP0DP43 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CatspereP0DP43 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms