Protein–RNA interactions for Protein: P09631

Hoxa9, Homeobox protein Hox-A9, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa9P09631 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxa9P09631 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxa9P09631 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxa9P09631 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxa9P09631 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxa9P09631 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxa9P09631 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxa9P09631 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxa9P09631 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxa9P09631 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxa9P09631 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hoxa9P09631 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hoxa9P09631 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hoxa9P09631 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxa9P09631 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxa9P09631 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxa9P09631 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxa9P09631 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxa9P09631 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxa9P09631 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxa9P09631 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxa9P09631 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxa9P09631 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxa9P09631 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxa9P09631 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxa9P09631 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxa9P09631 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxa9P09631 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxa9P09631 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxa9P09631 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxa9P09631 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxa9P09631 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxa9P09631 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxa9P09631 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxa9P09631 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxa9P09631 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxa9P09631 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxa9P09631 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxa9P09631 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxa9P09631 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxa9P09631 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxa9P09631 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxa9P09631 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxa9P09631 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxa9P09631 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxa9P09631 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxa9P09631 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxa9P09631 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxa9P09631 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxa9P09631 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxa9P09631 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxa9P09631 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxa9P09631 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxa9P09631 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxa9P09631 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxa9P09631 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxa9P09631 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxa9P09631 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxa9P09631 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxa9P09631 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hoxa9P09631 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hoxa9P09631 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxa9P09631 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxa9P09631 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxa9P09631 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxa9P09631 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxa9P09631 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxa9P09631 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxa9P09631 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxa9P09631 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Hoxa9P09631 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxa9P09631 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxa9P09631 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Hoxa9P09631 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxa9P09631 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxa9P09631 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxa9P09631 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxa9P09631 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxa9P09631 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxa9P09631 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxa9P09631 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxa9P09631 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxa9P09631 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxa9P09631 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxa9P09631 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxa9P09631 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxa9P09631 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxa9P09631 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxa9P09631 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxa9P09631 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxa9P09631 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxa9P09631 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxa9P09631 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Hoxa9P09631 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxa9P09631 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxa9P09631 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxa9P09631 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxa9P09631 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxa9P09631 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxa9P09631 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms