Protein–RNA interactions for Protein: P08775

Polr2a, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2aP08775 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Polr2aP08775 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Polr2aP08775 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Polr2aP08775 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Polr2aP08775 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Polr2aP08775 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Polr2aP08775 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Polr2aP08775 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Polr2aP08775 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Polr2aP08775 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Polr2aP08775 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Polr2aP08775 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Polr2aP08775 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Polr2aP08775 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Polr2aP08775 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Polr2aP08775 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Polr2aP08775 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Polr2aP08775 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Polr2aP08775 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Polr2aP08775 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Polr2aP08775 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Polr2aP08775 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Polr2aP08775 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Polr2aP08775 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Polr2aP08775 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Polr2aP08775 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Polr2aP08775 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Polr2aP08775 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Polr2aP08775 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Polr2aP08775 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Polr2aP08775 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Polr2aP08775 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Polr2aP08775 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Polr2aP08775 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Polr2aP08775 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Polr2aP08775 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Polr2aP08775 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Polr2aP08775 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Polr2aP08775 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Polr2aP08775 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Polr2aP08775 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Polr2aP08775 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Polr2aP08775 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Polr2aP08775 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Polr2aP08775 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Polr2aP08775 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Polr2aP08775 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Polr2aP08775 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Polr2aP08775 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Polr2aP08775 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Polr2aP08775 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Polr2aP08775 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Polr2aP08775 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Polr2aP08775 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Polr2aP08775 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Polr2aP08775 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Polr2aP08775 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Polr2aP08775 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Polr2aP08775 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Polr2aP08775 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Polr2aP08775 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Polr2aP08775 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Polr2aP08775 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Polr2aP08775 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Polr2aP08775 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
Polr2aP08775 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Polr2aP08775 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Polr2aP08775 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Polr2aP08775 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Polr2aP08775 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Polr2aP08775 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Polr2aP08775 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Polr2aP08775 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Polr2aP08775 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Polr2aP08775 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Polr2aP08775 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Polr2aP08775 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Polr2aP08775 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Polr2aP08775 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Polr2aP08775 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Polr2aP08775 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Polr2aP08775 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Polr2aP08775 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Polr2aP08775 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Polr2aP08775 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Polr2aP08775 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Polr2aP08775 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Polr2aP08775 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Polr2aP08775 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Polr2aP08775 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Polr2aP08775 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Polr2aP08775 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Polr2aP08775 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Polr2aP08775 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Polr2aP08775 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Polr2aP08775 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Polr2aP08775 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Polr2aP08775 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Polr2aP08775 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Polr2aP08775 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms