Protein–RNA interactions for Protein: P05977

Myl1, Myosin light chain 1/3, skeletal muscle isoform, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myl1P05977 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Myl1P05977 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Myl1P05977 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Myl1P05977 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Myl1P05977 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Myl1P05977 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Myl1P05977 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Myl1P05977 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Myl1P05977 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Myl1P05977 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Myl1P05977 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Myl1P05977 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Myl1P05977 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Myl1P05977 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Myl1P05977 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Myl1P05977 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Myl1P05977 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Myl1P05977 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Myl1P05977 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Myl1P05977 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Myl1P05977 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Myl1P05977 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Myl1P05977 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Myl1P05977 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Myl1P05977 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Myl1P05977 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Myl1P05977 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Myl1P05977 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Myl1P05977 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Myl1P05977 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Myl1P05977 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Myl1P05977 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Myl1P05977 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Myl1P05977 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Myl1P05977 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Myl1P05977 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Myl1P05977 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Myl1P05977 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Myl1P05977 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Myl1P05977 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Myl1P05977 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Myl1P05977 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Myl1P05977 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Myl1P05977 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Myl1P05977 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Myl1P05977 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Myl1P05977 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Myl1P05977 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Myl1P05977 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Myl1P05977 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Myl1P05977 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Myl1P05977 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Myl1P05977 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Myl1P05977 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Myl1P05977 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Myl1P05977 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Myl1P05977 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Myl1P05977 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Myl1P05977 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Myl1P05977 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Myl1P05977 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Myl1P05977 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Myl1P05977 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Myl1P05977 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Myl1P05977 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Myl1P05977 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Myl1P05977 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Myl1P05977 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Myl1P05977 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Myl1P05977 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Myl1P05977 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Myl1P05977 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Myl1P05977 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Myl1P05977 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Myl1P05977 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Myl1P05977 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Myl1P05977 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Myl1P05977 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Myl1P05977 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Myl1P05977 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Myl1P05977 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Myl1P05977 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Myl1P05977 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Myl1P05977 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Myl1P05977 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Myl1P05977 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Myl1P05977 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Myl1P05977 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Myl1P05977 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Myl1P05977 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Myl1P05977 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Myl1P05977 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Myl1P05977 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Myl1P05977 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Myl1P05977 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Myl1P05977 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Myl1P05977 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Myl1P05977 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Myl1P05977 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Myl1P05977 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms