Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
H2-Eb1P04230 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
H2-Eb1P04230 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
H2-Eb1P04230 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
H2-Eb1P04230 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
H2-Eb1P04230 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
H2-Eb1P04230 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
H2-Eb1P04230 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
H2-Eb1P04230 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
H2-Eb1P04230 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
H2-Eb1P04230 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
H2-Eb1P04230 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
H2-Eb1P04230 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
H2-Eb1P04230 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
H2-Eb1P04230 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
H2-Eb1P04230 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
H2-Eb1P04230 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
H2-Eb1P04230 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
H2-Eb1P04230 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
H2-Eb1P04230 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
H2-Eb1P04230 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
H2-Eb1P04230 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
H2-Eb1P04230 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
H2-Eb1P04230 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
H2-Eb1P04230 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
H2-Eb1P04230 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
H2-Eb1P04230 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
H2-Eb1P04230 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
H2-Eb1P04230 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
H2-Eb1P04230 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
H2-Eb1P04230 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
H2-Eb1P04230 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
H2-Eb1P04230 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
H2-Eb1P04230 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
H2-Eb1P04230 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
H2-Eb1P04230 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
H2-Eb1P04230 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
H2-Eb1P04230 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
H2-Eb1P04230 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
H2-Eb1P04230 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
H2-Eb1P04230 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
H2-Eb1P04230 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
H2-Eb1P04230 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
H2-Eb1P04230 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
H2-Eb1P04230 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
H2-Eb1P04230 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
H2-Eb1P04230 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
H2-Eb1P04230 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
H2-Eb1P04230 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
H2-Eb1P04230 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
H2-Eb1P04230 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
H2-Eb1P04230 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
H2-Eb1P04230 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
H2-Eb1P04230 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
H2-Eb1P04230 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
H2-Eb1P04230 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
H2-Eb1P04230 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
H2-Eb1P04230 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
H2-Eb1P04230 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
H2-Eb1P04230 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
H2-Eb1P04230 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
H2-Eb1P04230 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
H2-Eb1P04230 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
H2-Eb1P04230 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
H2-Eb1P04230 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
H2-Eb1P04230 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
H2-Eb1P04230 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
H2-Eb1P04230 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
H2-Eb1P04230 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
H2-Eb1P04230 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
H2-Eb1P04230 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
H2-Eb1P04230 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
H2-Eb1P04230 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
H2-Eb1P04230 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
H2-Eb1P04230 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
H2-Eb1P04230 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
H2-Eb1P04230 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
H2-Eb1P04230 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
H2-Eb1P04230 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
H2-Eb1P04230 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
H2-Eb1P04230 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
H2-Eb1P04230 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
H2-Eb1P04230 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
H2-Eb1P04230 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
H2-Eb1P04230 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
H2-Eb1P04230 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
H2-Eb1P04230 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
H2-Eb1P04230 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
H2-Eb1P04230 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
H2-Eb1P04230 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
H2-Eb1P04230 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
H2-Eb1P04230 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
H2-Eb1P04230 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
H2-Eb1P04230 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
H2-Eb1P04230 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
H2-Eb1P04230 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
H2-Eb1P04230 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
H2-Eb1P04230 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
H2-Eb1P04230 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
H2-Eb1P04230 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms