Protein–RNA interactions for Protein: P02535

Krt10, Keratin, type I cytoskeletal 10, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt10P02535 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt10P02535 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt10P02535 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt10P02535 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt10P02535 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt10P02535 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt10P02535 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt10P02535 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt10P02535 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt10P02535 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt10P02535 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt10P02535 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt10P02535 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt10P02535 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt10P02535 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt10P02535 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt10P02535 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt10P02535 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt10P02535 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt10P02535 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt10P02535 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt10P02535 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt10P02535 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt10P02535 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt10P02535 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt10P02535 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt10P02535 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt10P02535 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt10P02535 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt10P02535 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt10P02535 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt10P02535 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt10P02535 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt10P02535 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt10P02535 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt10P02535 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt10P02535 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt10P02535 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt10P02535 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt10P02535 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt10P02535 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt10P02535 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt10P02535 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt10P02535 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt10P02535 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt10P02535 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt10P02535 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt10P02535 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt10P02535 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt10P02535 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt10P02535 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt10P02535 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt10P02535 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt10P02535 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt10P02535 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt10P02535 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt10P02535 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt10P02535 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt10P02535 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt10P02535 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt10P02535 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt10P02535 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt10P02535 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt10P02535 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt10P02535 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt10P02535 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt10P02535 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt10P02535 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt10P02535 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt10P02535 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt10P02535 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt10P02535 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt10P02535 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt10P02535 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt10P02535 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt10P02535 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt10P02535 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt10P02535 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt10P02535 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt10P02535 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt10P02535 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt10P02535 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt10P02535 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt10P02535 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt10P02535 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt10P02535 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt10P02535 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt10P02535 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt10P02535 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt10P02535 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt10P02535 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt10P02535 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt10P02535 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt10P02535 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt10P02535 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt10P02535 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt10P02535 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt10P02535 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt10P02535 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt10P02535 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms