Protein–RNA interactions for Protein: P01794

Ig heavy chain V region HPCG14, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01794 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01794 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01794 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01794 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01794 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01794 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01794 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01794 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01794 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01794 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01794 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01794 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01794 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01794 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01794 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01794 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01794 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01794 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01794 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01794 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01794 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01794 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01794 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01794 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01794 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01794 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01794 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01794 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01794 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01794 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01794 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01794 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01794 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01794 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01794 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01794 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
P01794 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01794 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01794 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01794 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01794 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01794 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01794 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
P01794 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
P01794 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01794 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01794 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01794 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01794 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01794 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01794 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01794 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01794 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01794 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01794 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01794 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01794 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01794 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01794 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01794 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01794 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01794 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01794 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01794 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01794 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC15.03■□□□□ -0
P01794 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01794 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01794 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01794 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01794 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01794 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01794 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01794 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01794 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01794 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01794 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01794 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01794 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
P01794 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P01794 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
P01794 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P01794 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P01794 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P01794 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P01794 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01794 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01794 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01794 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01794 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01794 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01794 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01794 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01794 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01794 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01794 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01794 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P01794 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P01794 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P01794 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P01794 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms