Protein–RNA interactions for Protein: P01788

Ig heavy chain V region H8, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01788 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01788 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01788 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01788 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01788 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01788 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01788 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01788 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01788 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
P01788 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01788 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
P01788 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01788 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01788 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01788 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01788 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01788 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01788 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01788 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01788 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01788 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01788 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01788 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01788 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01788 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
P01788 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
P01788 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
P01788 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01788 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01788 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01788 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01788 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01788 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01788 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01788 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01788 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01788 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01788 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01788 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01788 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01788 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01788 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01788 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01788 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01788 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01788 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01788 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01788 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01788 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01788 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01788 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01788 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01788 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01788 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
P01788 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
P01788 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01788 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01788 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
P01788 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01788 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01788 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01788 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01788 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01788 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01788 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01788 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01788 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01788 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01788 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01788 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01788 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01788 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01788 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01788 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01788 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
P01788 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01788 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01788 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01788 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01788 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01788 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01788 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01788 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01788 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01788 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01788 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
P01788 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01788 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01788 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01788 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01788 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01788 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01788 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01788 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01788 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01788 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01788 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01788 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01788 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01788 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms