Protein–RNA interactions for Protein: O89116

Vti1a, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1aO89116 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vti1aO89116 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vti1aO89116 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vti1aO89116 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vti1aO89116 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vti1aO89116 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vti1aO89116 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vti1aO89116 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vti1aO89116 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vti1aO89116 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vti1aO89116 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vti1aO89116 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vti1aO89116 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Vti1aO89116 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Vti1aO89116 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vti1aO89116 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vti1aO89116 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Vti1aO89116 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vti1aO89116 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vti1aO89116 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vti1aO89116 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vti1aO89116 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vti1aO89116 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vti1aO89116 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vti1aO89116 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vti1aO89116 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vti1aO89116 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vti1aO89116 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vti1aO89116 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vti1aO89116 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vti1aO89116 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vti1aO89116 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vti1aO89116 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vti1aO89116 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Vti1aO89116 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vti1aO89116 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Vti1aO89116 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vti1aO89116 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vti1aO89116 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vti1aO89116 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vti1aO89116 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vti1aO89116 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vti1aO89116 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vti1aO89116 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vti1aO89116 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vti1aO89116 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vti1aO89116 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vti1aO89116 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Vti1aO89116 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vti1aO89116 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vti1aO89116 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vti1aO89116 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vti1aO89116 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vti1aO89116 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vti1aO89116 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vti1aO89116 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vti1aO89116 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vti1aO89116 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vti1aO89116 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vti1aO89116 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vti1aO89116 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vti1aO89116 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vti1aO89116 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vti1aO89116 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vti1aO89116 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vti1aO89116 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vti1aO89116 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vti1aO89116 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vti1aO89116 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vti1aO89116 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vti1aO89116 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vti1aO89116 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vti1aO89116 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vti1aO89116 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vti1aO89116 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vti1aO89116 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vti1aO89116 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vti1aO89116 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vti1aO89116 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vti1aO89116 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vti1aO89116 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vti1aO89116 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vti1aO89116 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vti1aO89116 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vti1aO89116 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vti1aO89116 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vti1aO89116 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vti1aO89116 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vti1aO89116 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vti1aO89116 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vti1aO89116 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Vti1aO89116 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vti1aO89116 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vti1aO89116 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vti1aO89116 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vti1aO89116 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vti1aO89116 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vti1aO89116 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vti1aO89116 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vti1aO89116 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms