Protein–RNA interactions for Protein: O89112

Lancl1, LanC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lancl1O89112 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lancl1O89112 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Lancl1O89112 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lancl1O89112 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lancl1O89112 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lancl1O89112 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lancl1O89112 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lancl1O89112 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lancl1O89112 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lancl1O89112 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lancl1O89112 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lancl1O89112 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Lancl1O89112 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lancl1O89112 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lancl1O89112 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lancl1O89112 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lancl1O89112 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lancl1O89112 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lancl1O89112 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lancl1O89112 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lancl1O89112 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lancl1O89112 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lancl1O89112 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lancl1O89112 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lancl1O89112 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lancl1O89112 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lancl1O89112 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lancl1O89112 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Lancl1O89112 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lancl1O89112 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lancl1O89112 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lancl1O89112 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lancl1O89112 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lancl1O89112 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lancl1O89112 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lancl1O89112 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lancl1O89112 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lancl1O89112 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lancl1O89112 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lancl1O89112 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lancl1O89112 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lancl1O89112 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lancl1O89112 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lancl1O89112 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lancl1O89112 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lancl1O89112 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lancl1O89112 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lancl1O89112 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lancl1O89112 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lancl1O89112 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lancl1O89112 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lancl1O89112 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lancl1O89112 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lancl1O89112 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lancl1O89112 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lancl1O89112 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lancl1O89112 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lancl1O89112 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lancl1O89112 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Lancl1O89112 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lancl1O89112 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lancl1O89112 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lancl1O89112 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lancl1O89112 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lancl1O89112 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lancl1O89112 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lancl1O89112 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lancl1O89112 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lancl1O89112 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lancl1O89112 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lancl1O89112 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lancl1O89112 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Lancl1O89112 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lancl1O89112 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Lancl1O89112 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lancl1O89112 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lancl1O89112 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lancl1O89112 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lancl1O89112 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lancl1O89112 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lancl1O89112 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lancl1O89112 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lancl1O89112 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lancl1O89112 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lancl1O89112 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lancl1O89112 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Lancl1O89112 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Lancl1O89112 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lancl1O89112 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lancl1O89112 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lancl1O89112 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Lancl1O89112 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Lancl1O89112 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lancl1O89112 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lancl1O89112 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lancl1O89112 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lancl1O89112 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lancl1O89112 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lancl1O89112 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lancl1O89112 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms