Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Casp8O89110 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Casp8O89110 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Casp8O89110 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Casp8O89110 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Casp8O89110 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Casp8O89110 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Casp8O89110 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Casp8O89110 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Casp8O89110 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Casp8O89110 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Casp8O89110 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Casp8O89110 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Casp8O89110 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Casp8O89110 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Casp8O89110 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Casp8O89110 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Casp8O89110 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Casp8O89110 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Casp8O89110 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Casp8O89110 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Casp8O89110 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Casp8O89110 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Casp8O89110 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.3■■□□□ 1
Casp8O89110 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Casp8O89110 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Casp8O89110 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Casp8O89110 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Casp8O89110 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Casp8O89110 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Casp8O89110 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Casp8O89110 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Casp8O89110 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Casp8O89110 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Casp8O89110 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Casp8O89110 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Casp8O89110 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Casp8O89110 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Casp8O89110 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Casp8O89110 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Casp8O89110 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Casp8O89110 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Casp8O89110 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Casp8O89110 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Casp8O89110 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Casp8O89110 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Casp8O89110 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Casp8O89110 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Casp8O89110 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Casp8O89110 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Casp8O89110 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Casp8O89110 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Casp8O89110 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Casp8O89110 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Casp8O89110 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Casp8O89110 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Casp8O89110 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Casp8O89110 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Casp8O89110 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Casp8O89110 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Casp8O89110 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Casp8O89110 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Casp8O89110 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Casp8O89110 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Casp8O89110 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Casp8O89110 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Casp8O89110 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Casp8O89110 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Casp8O89110 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Casp8O89110 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Casp8O89110 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Casp8O89110 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Casp8O89110 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Casp8O89110 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Casp8O89110 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Casp8O89110 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Casp8O89110 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Casp8O89110 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Casp8O89110 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Casp8O89110 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Casp8O89110 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Casp8O89110 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Casp8O89110 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Casp8O89110 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Casp8O89110 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Casp8O89110 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Casp8O89110 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Casp8O89110 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Casp8O89110 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Casp8O89110 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Casp8O89110 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Casp8O89110 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Casp8O89110 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Casp8O89110 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Casp8O89110 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Casp8O89110 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Casp8O89110 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Casp8O89110 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Casp8O89110 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Casp8O89110 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms