Protein–RNA interactions for Protein: O89079

Cope, Coatomer subunit epsilon, mousemouse

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopeO89079 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CopeO89079 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CopeO89079 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CopeO89079 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CopeO89079 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CopeO89079 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CopeO89079 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CopeO89079 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CopeO89079 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CopeO89079 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CopeO89079 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CopeO89079 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CopeO89079 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CopeO89079 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CopeO89079 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CopeO89079 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CopeO89079 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CopeO89079 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CopeO89079 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CopeO89079 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CopeO89079 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CopeO89079 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CopeO89079 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CopeO89079 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CopeO89079 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CopeO89079 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CopeO89079 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CopeO89079 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CopeO89079 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CopeO89079 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CopeO89079 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CopeO89079 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CopeO89079 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CopeO89079 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CopeO89079 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CopeO89079 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CopeO89079 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CopeO89079 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CopeO89079 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CopeO89079 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CopeO89079 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CopeO89079 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CopeO89079 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CopeO89079 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CopeO89079 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CopeO89079 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CopeO89079 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CopeO89079 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CopeO89079 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CopeO89079 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CopeO89079 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CopeO89079 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CopeO89079 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CopeO89079 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CopeO89079 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CopeO89079 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CopeO89079 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CopeO89079 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CopeO89079 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CopeO89079 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CopeO89079 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CopeO89079 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CopeO89079 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CopeO89079 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CopeO89079 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CopeO89079 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CopeO89079 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CopeO89079 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CopeO89079 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CopeO89079 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CopeO89079 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CopeO89079 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CopeO89079 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CopeO89079 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CopeO89079 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CopeO89079 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CopeO89079 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CopeO89079 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CopeO89079 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CopeO89079 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CopeO89079 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CopeO89079 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CopeO89079 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CopeO89079 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CopeO89079 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CopeO89079 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CopeO89079 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CopeO89079 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CopeO89079 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CopeO89079 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CopeO89079 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CopeO89079 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CopeO89079 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CopeO89079 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CopeO89079 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CopeO89079 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CopeO89079 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CopeO89079 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CopeO89079 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CopeO89079 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
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