Protein–RNA interactions for Protein: O89026

Robo1, Roundabout homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo1O89026 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Robo1O89026 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Robo1O89026 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Robo1O89026 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Robo1O89026 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Robo1O89026 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Robo1O89026 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Robo1O89026 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Robo1O89026 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Robo1O89026 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Robo1O89026 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Robo1O89026 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Robo1O89026 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Robo1O89026 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Robo1O89026 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Robo1O89026 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Robo1O89026 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Robo1O89026 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Robo1O89026 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Robo1O89026 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Robo1O89026 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Robo1O89026 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Robo1O89026 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Robo1O89026 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Robo1O89026 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Robo1O89026 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Robo1O89026 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Robo1O89026 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Robo1O89026 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Robo1O89026 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Robo1O89026 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Robo1O89026 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Robo1O89026 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Robo1O89026 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Robo1O89026 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Robo1O89026 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Robo1O89026 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Robo1O89026 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Robo1O89026 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Robo1O89026 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Robo1O89026 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Robo1O89026 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Robo1O89026 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Robo1O89026 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Robo1O89026 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Robo1O89026 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Robo1O89026 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Robo1O89026 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Robo1O89026 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Robo1O89026 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Robo1O89026 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Robo1O89026 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Robo1O89026 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Robo1O89026 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Robo1O89026 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Robo1O89026 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Robo1O89026 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Robo1O89026 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Robo1O89026 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Robo1O89026 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Robo1O89026 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Robo1O89026 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Robo1O89026 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Robo1O89026 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Robo1O89026 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Robo1O89026 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Robo1O89026 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Robo1O89026 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Robo1O89026 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Robo1O89026 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Robo1O89026 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Robo1O89026 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Robo1O89026 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Robo1O89026 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Robo1O89026 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Robo1O89026 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Robo1O89026 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Robo1O89026 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Robo1O89026 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Robo1O89026 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Robo1O89026 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Robo1O89026 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Robo1O89026 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Robo1O89026 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Robo1O89026 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Robo1O89026 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Robo1O89026 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Robo1O89026 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Robo1O89026 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Robo1O89026 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Robo1O89026 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Robo1O89026 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Robo1O89026 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Robo1O89026 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Robo1O89026 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Robo1O89026 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Robo1O89026 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Robo1O89026 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Robo1O89026 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Robo1O89026 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms