Protein–RNA interactions for Protein: O88940

Msc, Musculin, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MscO88940 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MscO88940 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MscO88940 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MscO88940 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MscO88940 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MscO88940 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MscO88940 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MscO88940 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MscO88940 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MscO88940 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MscO88940 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MscO88940 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MscO88940 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MscO88940 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MscO88940 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MscO88940 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MscO88940 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MscO88940 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MscO88940 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MscO88940 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MscO88940 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MscO88940 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MscO88940 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MscO88940 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MscO88940 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MscO88940 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MscO88940 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MscO88940 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MscO88940 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MscO88940 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MscO88940 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MscO88940 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
MscO88940 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MscO88940 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MscO88940 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MscO88940 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MscO88940 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MscO88940 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MscO88940 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MscO88940 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MscO88940 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MscO88940 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MscO88940 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MscO88940 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MscO88940 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MscO88940 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MscO88940 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MscO88940 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MscO88940 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MscO88940 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MscO88940 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MscO88940 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MscO88940 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MscO88940 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MscO88940 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MscO88940 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MscO88940 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MscO88940 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MscO88940 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MscO88940 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MscO88940 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MscO88940 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MscO88940 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MscO88940 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
MscO88940 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MscO88940 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MscO88940 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MscO88940 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MscO88940 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MscO88940 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MscO88940 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MscO88940 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MscO88940 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MscO88940 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
MscO88940 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
MscO88940 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MscO88940 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MscO88940 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
MscO88940 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MscO88940 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MscO88940 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MscO88940 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MscO88940 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MscO88940 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MscO88940 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MscO88940 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MscO88940 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MscO88940 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MscO88940 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MscO88940 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MscO88940 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
MscO88940 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MscO88940 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MscO88940 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MscO88940 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MscO88940 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MscO88940 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MscO88940 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MscO88940 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MscO88940 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms