Protein–RNA interactions for Protein: O88792

F11r, Junctional adhesion molecule A, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F11rO88792 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F11rO88792 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F11rO88792 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
F11rO88792 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
F11rO88792 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
F11rO88792 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
F11rO88792 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
F11rO88792 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
F11rO88792 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
F11rO88792 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
F11rO88792 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
F11rO88792 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
F11rO88792 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
F11rO88792 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
F11rO88792 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
F11rO88792 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
F11rO88792 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
F11rO88792 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
F11rO88792 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
F11rO88792 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
F11rO88792 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
F11rO88792 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F11rO88792 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
F11rO88792 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F11rO88792 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F11rO88792 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F11rO88792 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F11rO88792 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
F11rO88792 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
F11rO88792 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
F11rO88792 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
F11rO88792 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
F11rO88792 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
F11rO88792 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
F11rO88792 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
F11rO88792 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
F11rO88792 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
F11rO88792 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
F11rO88792 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
F11rO88792 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
F11rO88792 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
F11rO88792 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
F11rO88792 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
F11rO88792 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
F11rO88792 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
F11rO88792 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
F11rO88792 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
F11rO88792 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
F11rO88792 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
F11rO88792 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
F11rO88792 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
F11rO88792 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
F11rO88792 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
F11rO88792 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
F11rO88792 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
F11rO88792 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
F11rO88792 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
F11rO88792 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
F11rO88792 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
F11rO88792 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
F11rO88792 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
F11rO88792 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
F11rO88792 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
F11rO88792 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
F11rO88792 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
F11rO88792 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
F11rO88792 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
F11rO88792 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
F11rO88792 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
F11rO88792 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
F11rO88792 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
F11rO88792 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
F11rO88792 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
F11rO88792 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
F11rO88792 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
F11rO88792 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
F11rO88792 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
F11rO88792 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
F11rO88792 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
F11rO88792 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
F11rO88792 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
F11rO88792 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
F11rO88792 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
F11rO88792 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
F11rO88792 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
F11rO88792 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
F11rO88792 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
F11rO88792 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
F11rO88792 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
F11rO88792 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
F11rO88792 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
F11rO88792 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
F11rO88792 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
F11rO88792 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
F11rO88792 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
F11rO88792 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
F11rO88792 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
F11rO88792 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
F11rO88792 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
F11rO88792 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms