Protein–RNA interactions for Protein: O88746

Tom1, Target of Myb protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1O88746 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Tom1O88746 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Tom1O88746 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Tom1O88746 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Tom1O88746 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Tom1O88746 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tom1O88746 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tom1O88746 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Tom1O88746 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tom1O88746 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tom1O88746 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tom1O88746 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tom1O88746 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Tom1O88746 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tom1O88746 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tom1O88746 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Tom1O88746 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Tom1O88746 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Tom1O88746 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Tom1O88746 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Tom1O88746 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Tom1O88746 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Tom1O88746 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Tom1O88746 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Tom1O88746 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Tom1O88746 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Tom1O88746 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Tom1O88746 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Tom1O88746 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Tom1O88746 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Tom1O88746 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Tom1O88746 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tom1O88746 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tom1O88746 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tom1O88746 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tom1O88746 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Tom1O88746 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Tom1O88746 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Tom1O88746 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Tom1O88746 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Tom1O88746 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Tom1O88746 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Tom1O88746 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Tom1O88746 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Tom1O88746 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Tom1O88746 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Tom1O88746 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Tom1O88746 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Tom1O88746 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tom1O88746 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tom1O88746 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Tom1O88746 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tom1O88746 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tom1O88746 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tom1O88746 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tom1O88746 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tom1O88746 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tom1O88746 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tom1O88746 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tom1O88746 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tom1O88746 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Tom1O88746 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Tom1O88746 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tom1O88746 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Tom1O88746 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Tom1O88746 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Tom1O88746 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Tom1O88746 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Tom1O88746 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Tom1O88746 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tom1O88746 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tom1O88746 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Tom1O88746 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tom1O88746 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tom1O88746 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tom1O88746 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Tom1O88746 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Tom1O88746 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Tom1O88746 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Tom1O88746 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Tom1O88746 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Tom1O88746 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Tom1O88746 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tom1O88746 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tom1O88746 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tom1O88746 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tom1O88746 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tom1O88746 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tom1O88746 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Tom1O88746 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Tom1O88746 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Tom1O88746 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Tom1O88746 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tom1O88746 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tom1O88746 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tom1O88746 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tom1O88746 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tom1O88746 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Tom1O88746 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Tom1O88746 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms