Protein–RNA interactions for Protein: O88741

Gdap1, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdap1O88741 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gdap1O88741 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gdap1O88741 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gdap1O88741 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gdap1O88741 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gdap1O88741 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gdap1O88741 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gdap1O88741 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gdap1O88741 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gdap1O88741 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gdap1O88741 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gdap1O88741 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gdap1O88741 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gdap1O88741 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gdap1O88741 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gdap1O88741 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gdap1O88741 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gdap1O88741 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gdap1O88741 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gdap1O88741 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gdap1O88741 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gdap1O88741 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gdap1O88741 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gdap1O88741 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gdap1O88741 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gdap1O88741 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gdap1O88741 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gdap1O88741 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gdap1O88741 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gdap1O88741 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gdap1O88741 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gdap1O88741 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gdap1O88741 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gdap1O88741 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gdap1O88741 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gdap1O88741 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gdap1O88741 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gdap1O88741 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gdap1O88741 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gdap1O88741 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gdap1O88741 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gdap1O88741 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gdap1O88741 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gdap1O88741 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gdap1O88741 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gdap1O88741 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gdap1O88741 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gdap1O88741 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gdap1O88741 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gdap1O88741 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Gdap1O88741 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gdap1O88741 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gdap1O88741 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gdap1O88741 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gdap1O88741 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gdap1O88741 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gdap1O88741 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gdap1O88741 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gdap1O88741 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gdap1O88741 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gdap1O88741 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gdap1O88741 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gdap1O88741 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gdap1O88741 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gdap1O88741 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gdap1O88741 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gdap1O88741 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gdap1O88741 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gdap1O88741 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gdap1O88741 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gdap1O88741 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gdap1O88741 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gdap1O88741 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gdap1O88741 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gdap1O88741 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gdap1O88741 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gdap1O88741 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gdap1O88741 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gdap1O88741 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gdap1O88741 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gdap1O88741 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gdap1O88741 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gdap1O88741 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gdap1O88741 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gdap1O88741 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gdap1O88741 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gdap1O88741 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gdap1O88741 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gdap1O88741 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gdap1O88741 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gdap1O88741 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gdap1O88741 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gdap1O88741 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gdap1O88741 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gdap1O88741 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gdap1O88741 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gdap1O88741 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gdap1O88741 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gdap1O88741 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gdap1O88741 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms