Protein–RNA interactions for Protein: O88643

Pak1, Serine/threonine-protein kinase PAK 1, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pak1O88643 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pak1O88643 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pak1O88643 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pak1O88643 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pak1O88643 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pak1O88643 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pak1O88643 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pak1O88643 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pak1O88643 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pak1O88643 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pak1O88643 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pak1O88643 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pak1O88643 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pak1O88643 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pak1O88643 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pak1O88643 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pak1O88643 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pak1O88643 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Pak1O88643 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pak1O88643 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pak1O88643 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pak1O88643 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pak1O88643 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pak1O88643 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Pak1O88643 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pak1O88643 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pak1O88643 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pak1O88643 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pak1O88643 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pak1O88643 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pak1O88643 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pak1O88643 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pak1O88643 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pak1O88643 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pak1O88643 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pak1O88643 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pak1O88643 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pak1O88643 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Pak1O88643 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Pak1O88643 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pak1O88643 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pak1O88643 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Pak1O88643 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pak1O88643 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Pak1O88643 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Pak1O88643 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pak1O88643 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pak1O88643 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pak1O88643 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pak1O88643 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pak1O88643 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pak1O88643 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pak1O88643 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pak1O88643 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pak1O88643 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pak1O88643 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pak1O88643 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pak1O88643 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pak1O88643 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Pak1O88643 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pak1O88643 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pak1O88643 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pak1O88643 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pak1O88643 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pak1O88643 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pak1O88643 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pak1O88643 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pak1O88643 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pak1O88643 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pak1O88643 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pak1O88643 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pak1O88643 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pak1O88643 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pak1O88643 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pak1O88643 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pak1O88643 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pak1O88643 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pak1O88643 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pak1O88643 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pak1O88643 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Pak1O88643 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pak1O88643 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pak1O88643 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pak1O88643 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pak1O88643 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pak1O88643 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pak1O88643 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pak1O88643 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pak1O88643 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pak1O88643 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Pak1O88643 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pak1O88643 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pak1O88643 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pak1O88643 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pak1O88643 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pak1O88643 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pak1O88643 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pak1O88643 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pak1O88643 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pak1O88643 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms