Protein–RNA interactions for Protein: O88561

Slc27a3, Long-chain fatty acid transport protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a3O88561 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Slc27a3O88561 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slc27a3O88561 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slc27a3O88561 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slc27a3O88561 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slc27a3O88561 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slc27a3O88561 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slc27a3O88561 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slc27a3O88561 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slc27a3O88561 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Slc27a3O88561 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slc27a3O88561 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slc27a3O88561 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slc27a3O88561 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slc27a3O88561 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Slc27a3O88561 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Slc27a3O88561 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Slc27a3O88561 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Slc27a3O88561 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Slc27a3O88561 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Slc27a3O88561 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Slc27a3O88561 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Slc27a3O88561 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Slc27a3O88561 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Slc27a3O88561 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slc27a3O88561 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slc27a3O88561 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slc27a3O88561 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slc27a3O88561 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc27a3O88561 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc27a3O88561 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc27a3O88561 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc27a3O88561 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc27a3O88561 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc27a3O88561 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc27a3O88561 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc27a3O88561 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc27a3O88561 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc27a3O88561 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc27a3O88561 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc27a3O88561 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc27a3O88561 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slc27a3O88561 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slc27a3O88561 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc27a3O88561 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc27a3O88561 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc27a3O88561 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc27a3O88561 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc27a3O88561 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc27a3O88561 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc27a3O88561 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc27a3O88561 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc27a3O88561 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc27a3O88561 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc27a3O88561 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc27a3O88561 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc27a3O88561 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc27a3O88561 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc27a3O88561 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc27a3O88561 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Slc27a3O88561 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slc27a3O88561 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slc27a3O88561 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slc27a3O88561 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc27a3O88561 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc27a3O88561 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc27a3O88561 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc27a3O88561 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc27a3O88561 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc27a3O88561 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc27a3O88561 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc27a3O88561 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc27a3O88561 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc27a3O88561 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc27a3O88561 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc27a3O88561 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc27a3O88561 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc27a3O88561 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc27a3O88561 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc27a3O88561 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc27a3O88561 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc27a3O88561 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Slc27a3O88561 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Slc27a3O88561 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slc27a3O88561 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slc27a3O88561 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slc27a3O88561 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slc27a3O88561 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slc27a3O88561 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slc27a3O88561 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slc27a3O88561 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc27a3O88561 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc27a3O88561 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc27a3O88561 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc27a3O88561 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc27a3O88561 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc27a3O88561 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc27a3O88561 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc27a3O88561 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc27a3O88561 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms